Exploring Differentially Methylated Genes among Preterm Birth and Full-Term Birth
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Preterm birth (PTB) is a major contributor to neonatal morbidity and mortality. DNA methylation plays a critical role in fetal development and may serve as an epigenetic biomarker for PTB. However, few epigenetic studies have investigated PTB-specific DNA methylation changes. This study aimed to identify epigenetic differences between PTB and term birth (TB) infants. METHODS: A total of 218 cord blood samples from three independent PTB studies were analyzed to identify epigenetic differences between PTB and TB infants. Differential methylation analysis was conducted while adjusting for key covariates, including gestational age, sex, and disease status. Differentially methylated regions (DMRs) (genes and promoters) and differentially methylated sites (DMSs) (CpG sites) were assessed for significant methylation differences between the two groups. RESULTS: In PTB infants, several genes, including RNASE3, HGF, CLEC5A, LIPN, NXF1, and CCDC12 showed significant hypermethylation (p < 0.05), while the MUC20 and IFNL4 genes showed significant hypomethylation (p < 0.05). The eForge analysis revealed that hypermethylated (p < 0.05) CpG sites were significantly enriched in different fetal tissues such as the small and large intestines, adrenal gland, fetal heart, lungs, and kidney, whereas hypomethylated CpGs showed no significant enrichment. Gene ontology analysis indicated that differentially methylated genes were primarily involved in immune response regulation. Notably, S100A9 and S100A8 genes, which play crucial roles in neonatal immune function and sepsis risk, were hypermethylated (p < 0.05) in PTB infants. CONCLUSION: This study identified PTB-associated DNA methylation changes in immune-related genes, suggesting their potential epigenetic biomarkers for PTB. These findings enhance our understanding of PTB pathogenesis and may contribute to the development of novel diagnostic and therapeutic strategies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».