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Enregistrement W4405995913 · doi:10.1038/s41588-024-01978-2

The impact of common and rare genetic variants on bradyarrhythmia development

2025· article· en· W4405995913 sur OpenAlexaff
Lu‐Chen Weng, Joel Rämö, Sean J. Jurgens, Shaan Khurshid, Mark Chaffin, Amelia Weber Hall, Valerie N. Morrill, Xin Wang, Victor Nauffal, Yan V. Sun, Dominik Beer, Simon Lee, Girish N. Nadkarni, ThuyVy Duong, Biqi Wang, Tomasz Czuba, Thomas R. Austin, Zachary T. Yoneda, Daniel J. Friedman, Anne Clayton, Matthew C. Hyman, Renae Judy, Allan C. Skanes, Kate M. Orland, Timothy Treu, Matthew T. Oetjens, Álvaro Alonso, Elsayed Z. Soliman, Honghuang Lin, Kathryn L. Lunetta, Jesper van der Pals, Tariq Z. Issa, Navid A. Nafissi, Heidi T. May, Peter Leong‐Sit, Carolina Roselli, Seung Hoan Choi, Goncalo Abecasis, Aris Baras, Michael Cantor, Giovanni Coppola, Aris N. Economides, Luca A. Lotta, John D. Overton, Jeffrey G. Reid, Alan R. Shuldiner, Christina Beechert, Caitlin Forsythe, Erin D. Fuller, Zhenhua Gu, Michael Lattari, Alexander Lopez, Thomas D. Schleicher, Maria Sotiropoulos Padilla, Louis Widom, Sarah E. Wolf, Manasi Pradhan, Kia Manoochehri, Ricardo H. Ulloa, Xiaodong Bai, Suganthi Balasubramanian, Andrew Blumenfeld, Boris Boutkov, Gisu Eom, Lukas Habegger, Alicia Hawes, Shareef Khalid, Olga Krasheninina, Rouel Lanche, Adam J. Mansfield, Evan K. Maxwell, Mrunali Nafde, Sean O’Keeffe, Max Orelus, Razvan Panea, Tommy Polanco, Ayesha Rasool, William Salerno, Jeffrey Staples, Marcus B. Jones, Lyndon J. Mitnaul, Habib Khan, Stacey Knight, Richard Karlsson Linnér, Connie R. Bezzina, Samuli Ripatti, Susan R. Heckbert, J. Michael Gaziano, Ruth J. F. Loos, Bruce M. Psaty, J. Gustav Smith, Emelia J. Benjamin, Dan E. Arking, Daniel J. Rader, Svati H. Shah, Dan M. Roden, Scott M. Damrauer, Lee L. Eckhardt, Jason D. Roberts, Michael J. Cutler, M. Benjamin Shoemaker, Christopher M. Haggerty, Kelly Cho, Aarno Palotie, Peter W.F. Wilson, Patrick T. Ellinor, Steven A. Lubitz

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCommon FundNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer InstituteNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Institutes of HealthNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseNational Institute on AgingHjärt-LungfondenAmerican Heart AssociationHartstichtingU.S. Department of Veterans AffairsStiftelsen för Strategisk ForskningOffice of Research and DevelopmentFondation LeducqEuropean CommissionSigrid Juséliuksen Säätiö
Mots-clésBiologyGeneticsComputational biologyEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To broaden our understanding of bradyarrhythmias and conduction disease, we performed common variant genome-wide association analyses in up to 1.3 million individuals and rare variant burden testing in 460,000 individuals for sinus node dysfunction (SND), distal conduction disease (DCD) and pacemaker (PM) implantation. We identified 13, 31 and 21 common variant loci for SND, DCD and PM, respectively. Four well-known loci (SCN5A/SCN10A, CCDC141, TBX20 and CAMK2D) were shared for SND and DCD, while others were more specific for SND or DCD. SND and DCD showed a moderate genetic correlation (rg = 0.63). Cardiomyocyte-expressed genes were enriched for contributions to DCD heritability. Rare-variant analyses implicated LMNA for all bradyarrhythmia phenotypes, SMAD6 and SCN5A for DCD and TTN, MYBPC3 and SCN5A for PM. These results show that variation in multiple genetic pathways (for example, ion channel function, cardiac developmental programs, sarcomeric structure and cellular homeostasis) appear critical to the development of bradyarrhythmias. Genome-wide analyses identify variants associated with sinus node dysfunction, distal conduction disease and pacemaker implantation, implicating ion channel function, cardiac developmental programs and sarcomeric structure in bradyarrhythmia susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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