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Enregistrement W4406030166 · doi:10.1002/alz.092619

Investigating the role of <i>SORL1</i> in mediating AD‐specific endolysosomal phenotypes in neurons and microglia

2024· article· en· W4406030166 sur OpenAlexaff
Brooke A. DeRosa, Yalun Zhang, C. Golightly, Lauren Coombs, Lauren E. Rothschild, Brian W. Kunkle, Michael L. Cuccaro, Jeffery M. Vance, Margaret A Pericak‐Vance, Peter St George‐Hyslop, Derek M. Dykxhoorn

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndosomeBiologyMicrogliaAmyloid precursor proteinCell biologyEndocytic cycleHEK 293 cellsPhenotypeSecretionAlzheimer's diseaseCell cultureCellImmunologyGeneticsGeneEndocytosisInflammationInternal medicineBiochemistryMedicineDiseaseIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Dysregulation of endolysosomal trafficking is a major pathogenic mechanism in Alzheimer’s disease (AD). From the family of AD‐linked endosomal pathway genes, SORL1 stands out as one of the highest risk factors. SORL1 encodes an endocytic sorting receptor that mediates endosomal trafficking and processing of key AD‐associated molecules, including pathogenic forms of amyloid‐β (e.g., Aβ42) and amyloid precursor protein (APP). Using complementary cell‐based model systems, we investigated the role of a protein‐truncating SORL1 variant on endolysosomal trafficking and APP processing. Method Induced pluripotent stem cell (iPSC) lines were derived from two siblings affected with early onset AD (EOAD) who carried a rare protein‐truncating deletion in SORL1 (rs1343336951; p.C1431fs). SORL1+/+ isogenic control iPSC lines were created from the patient lines using CRISPR/Cas9. After validation, the iPSC lines were differentiated into forebrain neurons and analyzed for endosomal trafficking defects. Additional analyses were completed in HEK293‐APPswe cells overexpressing SORL1 wild‐type (WT) or the C1431fs variant. Studies are underway that examine SORL1+/C1431fs microglia for defects in endolysosomal function. Result SORL1+/C1431fs neurons have increased localization of APP in early endosomes (p = 0.002), endosomal swelling (p = 0.004), and greater numbers of early endosomes per cell (p = 0.018). We additionally observe SORL1+/C1431fs neurons trending toward increased secretion of Aβ42 compared to controls. In HEK293 cells, C1431fs increased secretion of Aβ42 (p < 0.01), Aβ40 (p < 0.01), as well as APP soluble α‐secretase (sAPPα; p < 0.01) and β‐secretase (sAPPβ; p < 0.01) cleavage products. We additionally found C1431fs led to increased secretion of soluble SORL1 (p < 0.01). Surface biotinylation revealed C1431fs led to lower levels of SORL1 detected at the cell surface (p < 0.05). Conversely, C1431fs increased the amount of surface APP (p < 0.05). Conclusion Our results indicate that a single gene copy of the SORL1 C1431fs variant is sufficient to induce neuronal defects in endosomal trafficking and APP processing. Our findings are consistent with previously reported results from similar studies of SORL1 in cultured neurons. Ongoing studies in SORL1+/C1431fs microglia and neurons will help broaden our understanding of the role SORL1 plays in regulating endolysosomal phenotypes in multiple cell types implicated in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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