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Enregistrement W4406036940 · doi:10.1093/clinchem/hvae184

Genomic Data and Privacy

2025· article· en· W4406036940 sur OpenAlexaff
Candace T. Myers, Runjun D. Kumar, Lisa Pilgram, Luca Bonomi, Mara Thomas, Obi L. Griffith, Stephanie M. Fullerton, Richard A. Gibbs

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research Institute
Mots-clésLibrary scienceGenomic medicineMedicineGerontologyComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic testing has become more widespread due to several key factors, including technological advancements, reduced costs, integration into clinical care, increased public awareness, and commercialization. Sharing genetic data offers tremendous potential for advancing healthcare and knowledge. It also raises privacy concerns that require legal, ethical, and technological measures to address. Common privacy concerns include identification of an individual or blood relative from pseudonymized/anonymized data, inferring sensitive information (e.g., diagnosis or predisposition to disease) from genetic information, informing immediate family members of genetic risks with or without appropriate consent, and worries about data being misused and/or shared with third parties without adequate controls. The rules regarding privacy and genetic data vary by country and the context in which data is generated. In the United States, 3 major groups generate genetic data: (a) clinical laboratories that provide genetic testing to guide diagnostic, prognostic, and therapeutic decisions for individualized clinical care, (b) direct-to-consumer (DTC) testing that offers information on genetic ancestry and health traits and risks, and (c) research and biobank projects that drive scientific innovation and facilitate collaboration among researchers worldwide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,023
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,044
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,122

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0230,044
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0040,028
Communication savante0,0130,012
Science ouverte0,0020,008
Intégrité de la recherche0,0080,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,645
Tête enseignante GPT0,664
Écart entre enseignants0,019 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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