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Enregistrement W4406054137 · doi:10.26355/eurrev_202412_37002

A monoamine oxidase B inhibitor altered gene expression of catalytically active dual-specificity phosphatases in human oral gingival keratinocytes.

2024· article· en· W4406054137 sur OpenAlexaff
Mahyar Ostadkarampour, Edward E. Putnins

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonoamine oxidaseChemistryMonoamine oxidase BPhosphataseDual-specificity phosphataseGeneOxidase testEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Monoamine oxidase (MAO) inhibitors reduce inflammation in a number of in vitro and in vivo models. This finding led to the development of a novel MAO-B selective inhibitor (RG0216) designed to reduce blood-brain barrier penetration. To elucidate RG0216's regulatory role in inflammation-relevant signaling pathways, we employed a transcriptome analytic approach to identify genes that are differentially regulated by RG0216 and then globally identified which inflammation-relevant biological signaling pathways were altered by this drug. MATERIAL AND METHODS: Primary human gingival keratinocyte (HGK) cells were treated with RG0216, and RNA was extracted (4 h). RNAseq transcriptome analysis was utilized to identify differentially expressed genes (DEGs), while Gene Ontology (GO), and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analyses were used to identify significantly enriched biological pathways. Relevant genes associated with these pathways and RG0216 regulation of Porphyromonnas gingivalis lipopolysaccharide (PgLPS)-induced cytokine/chemokine expression were evaluated using the real-time quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) approach. RESULTS: RG0216 significantly altered the expression of 50 DEGs in HGK cells. Using GO and KEGG analytic approaches, these genes were associated with the biological pathways relevant to mitogen-activated protein kinase (MAPK) and MAPK phosphatases. These phosphatases are part of the 10-member catalytically active dual-specificity phosphatase (DUSP) family. RG0216 induced the expression of DUSP10, reduced the expression of DUSP4 and DUSP6, and decreased IL-6 and IL-8 expression in control and PgLPS-stimulated cultures. CONCLUSIONS: In HGK cells, a novel MAO-B inhibitor (RG0216) significantly altered DUSP4, DUSP6, and DUSP10 expression. DUSPs play a regulatory role in MAPK activity and, therefore, can alter cellular inflammatory responses. We found that RG0216 inhibited IL-6 and IL-8 expression. Further studies are planned to examine RG0216's regulatory role in DUSP expression and its impact on the regulation of cytokine/chemokine expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
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Résumé présentoui

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