Molecular genotyping revealed the gene flow of Puccinia striiformis f. sp. tritici clonal lineage from Uzbekistan of Central Asia to Xinjiang of China
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Wheat stripe rust, caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici ( Pst ), is an air-borne fungal disease, and its spores can be spread far away from its origin to colonize in new territory, causing inter-regional epidemics. Xinjiang not only is an important and independent epidemic region from other stripe rust epidemiological regions in China but also has distinguished Pst genetic structure and spatial features. However, the inoculum source of the rust in Xinjiang has remained unknown. It is not clear whether inocula in Central Asian countries migrate to Xinjiang and whether mutual gene flows possibly occur between both regions. We conducted a comparative population study of Pst populations in Xinjiang and Uzbekistan to better understand the Pst migration pattern and inoculum source of the rust in Xinjiang. Our results revealed high genetic diversity in Xinjiang (0.86, 63 MLGs out of 207 samples), compared with the Uzbekistan population (0.76, 47 MLGs out of 255 samples). Our analyses uncovered the clear migration of Uzbekistan Pst populations to Northwest Xinjiang, which is in proximity to Central Asia. The migration of clonal lineage could cause genetic drift and potential threat changing the genetic structure and virulence pattern of Pst in China. Further studies need to be conducted in the Xinjiang region to understand and evaluate the behavior of foreign genotypes in the local environment and their overall impact on local wheat crops.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».