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Enregistrement W4406135487 · doi:10.1016/j.isci.2025.111770

Super-enhancers and efficacy of triptolide in small cell carcinoma of the ovary hypercalcemic type

2025· article· en· W4406135487 sur OpenAlexafffund
Jessica D. Lang, William Selleck, Shawn Striker, Nicolle A. Hipschman, Rochelle Kofman, Anthony N. Karnezis, F. Kommoss, Friedrich Kommoss, Jae Rim Wendt, Salvatore Facista, William P.D. Hendricks, Krystal A. Orlando, Patrick Pirrotte, Elizabeth A. Raupach, Victoria Zismann, Yemin Wang, David G. Huntsman, Bernard E. Weissman, Jeffrey M. Trent

Notice bibliographique

RevueiScience · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthTerry Fox Research InstituteRivkin Center for Ovarian Cancer
Mots-clésOvaryTriptolideEnhancerCancer researchOvarian carcinomaChemistryBiologyInternal medicineCell biologyMedicineCancerApoptosisOvarian cancerBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Small cell carcinoma of the ovary-hypercalcemic type (SCCOHT) is a rare ovarian cancer affecting young females and is driven by the loss of both SWI/SNF ATPases SMARCA4 and SMARCA2. As loss of SWI/SNF alters enhancers, we hypothesized that super-enhancers, which regulate oncogene expression in cancer, are disparately impacted by SWI/SNF loss. We discovered differences between SWI/SNF occupancy at enhancers vs. super-enhancers. SCCOHT super-enhancer target genes were enriched in developmental processes, most notably nervous system development. This may further support neuronal cell-of-origin previously proposed. We found high sensitivity of SCCOHT cell lines to triptolide. Triptolide inhibits expression of many super-enhancer-associated genes, including oncogenes. SALL4 expression is decreased by triptolide and is highly expressed in SCCOHT tumors. In patient-derived xenograft models, triptolide and prodrug minnelide effectively inhibit tumor growth. These results reveal unique features of super-enhancers in SCCOHT, which may be one mechanism through which triptolide has high activity in these tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,129

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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