Dynamic remodeling of centrioles and the microtubule cytoskeleton in the lifecycle of chytrid fungi
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cells reorganize in space and time to move and divide – complex behaviors driven by their internal cytoskeleton. While we have substantial knowledge of the molecular parts and rules of cytoskeletal assembly, we know less about how structures are remodeled, for example to interconvert centrioles from the ciliary base to the centrosome. To study this in an evolutionary context we use the chytrid fungus, Rhizoclosmatium globosum , a member of the zoosporic fungi which have centrioles and cilia, lost in other fungal lineages. Chytrids undergo reorganization of their microtubule cytoskeleton as they cycle from zoospore to multinucleated coenocyte. We use comparative bioinformatics, RNA sequencing, and expansion microscopy to map the microtubule cytoskeleton over the chytrid lifecycle. We find that when zoospores encyst, cilia are retracted into the cytoplasm and degraded, and centrioles detach but are protected from degradation. A shortened proximal centriole then forms the mitotic centrosome and ultimately elongates to form cilia at the end of the mitotic cycles, driven by a conserved transcriptional program. Thus, structural remodeling of the chytrid centriole is coupled temporally to ciliated stages rather than mitotic cycles, which may serve as a mechanism to tune microtubule organization to meet the needs of different lifecycle stages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».