Predictors of <i>Cryptococcus gattii</i> Clinical Presentation and Outcome: An International Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Infection by Cryptococcus gattii can lead to pulmonary or central nervous system (CNS) disease, or both. Whether the sites of infection and disease severity are associated with C. gattii species and lineages or with certain underlying medical conditions, or both is unclear. We conducted a retrospective cohort study to identify factors associated with site of infection and mortality among C. gattii cases. METHODS: We extracted data on 258 C. gattii cases from Australia, Canada, and the United States reported from 1999 to 2011. We conducted unadjusted and multivariable logistic regression analyses to evaluate factors associated with site of infection and C. gattii mortality among hospitalized cases (N = 218). RESULTS: Hospitalized C. gattii cases with CNS and other extrapulmonary disease were younger, more likely to reside in Australia, and be infected with variety gattii I (VGI) lineage but less likely to have comorbidities and die as compared to cases with pulmonary disease. The odds of having CNS and/or other extrapulmonary disease were 9 times higher in cases with VGI infection (adjusted odds ratio [aOR] = 9.21, 95% confidence interval [CI] = 3.28-25.89). Age ≥70 years (aOR = 6.69, 95% CI = 2.44-18.30), chronic lung disease (aOR = 2.62, 95% CI = 1.05-6.51) and an immunocompromised status (aOR = 2.08, 95% CI = 1.05-6.51) were associated with higher odds of C. gattii mortality. CONCLUSIONS: Among hospitalized cases, C. gattii species and lineage are associated with site of infection but not with the risk of death, whereas older age and comorbidities increase the risk of death.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».