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Enregistrement W4406152943 · doi:10.1111/jfd.14045

Application of Conservation Genomics to Investigate the Role of Pathogens on the Migration of Sea‐Run Brown Trout (<i>Salmo trutta</i>)

2025· article· en· W4406152943 sur OpenAlexaff
Robert J. Lennox, Sindre Håvarstein Eldøy, Angela D. Schulze, Kristina M. Miller, Trond Einar Isaksen, Jan Grimsrud Davidsen, Cecilie I. Nilsen, Lotte S. Dahlmo, Knut Wiik Vollset

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaOcean Tracking NetworkDalhousie University
Organismes subventionnairesMiljødirektoratetNorges Forskningsråd
Mots-clésSalmoBrown troutBiologyPathogenZoologyTroutBioenergeticsEcologyFish <Actinopterygii>FisheryMicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogens play a key role in individual function and the dynamics of wild populations, but the link between pathogens and individual performance has rarely been investigated in the wild. Migrating salmonids offer an ideal study system to investigate how infection with pathogens affects performance given that climate change and fish farming portend increasing prevalence of pathogens in wild populations. To test for effects of pathogen burden on the performance of a migrating salmonid, we paired data from individual brown trout tagged with acoustic accelerometer transmitters and gill biopsies to investigate how pathogen infection affected whole animal activity during the spawning migration. Generalised additive models fitted to the acceleration data revealed individual and temporal variation in acceleration as expected, but also provided a significant effect of relative infection burden on acceleration. However, when linking this pathogen-specific effect to a relevant bioenergetic change, it was evident that the effect had little impact on the exercise-related oxygen consumption at the individual level, especially in cases where fish were not exerting high exercise activity. The results are a powerful example of how pairing non-lethal biopsies with individual tracking technologies can be used to assess how pathogens impact fish in situ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,160

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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