Recent progress in proteins regulating the germination of <i>Bacillus subtilis</i> spores
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Bacterial spores can remain dormant for years, but they maintain the ability to recommence life through a process termed germination. Although spore germination has been reviewed many times, recent work has provided novel conceptual and molecular understandings of this important process. By using Bacillus subtilis as a model organism, here we thoroughly describe the signal transduction pathway and events that lead to spore germination, incorporating the latest findings on transcription and translation that are likely detected during germination. Then, we comprehensively review the proteins associated with germination and their respective functions. Notably, the typical germinant receptor GerA and the SpoVAF/FigP complex have been newly established as channels for ions release at early stage of germination. Moreover, given that germination is also affected by spore quality, such as molecular cargo, we collect the data about the proteins regulating sporulation to affect spore quality. Specifically, RocG-mediated glutamate catabolism during sporulation to ensure spore quality; GerE-regulated coat protein expression, and CotH-modified coat protein by phosphorylation to ensure normal coat assembly; and RNase Y-degraded RNA in newly released spores to promote dormancy. The latest progress in our understanding of these germination proteins provides valuable insights into the mechanism underlying germination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».