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Enregistrement W4406185299 · doi:10.1242/jcs.263401

Rabin8 phosphorylated by NDR2, the canine early retinal degeneration gene product, directs rhodopsin Golgi-to-cilia trafficking

2025· article· en· W4406185299 sur OpenAlexafffund
Theresa Fresquez, Beatrice M. Tam, Shannon C. Eshelman, Orson L. Moritz, Michael A. Robichaux, Dusanka Deretic

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Eye InstituteBentham-Moxon TrustNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversity of New Mexico
Mots-clésBiologyGolgi apparatusCell biologyCiliogenesisRhodopsinCiliumRetinal degenerationCiliopathyRetinalBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Rab11-Rabin8-Rab8 ciliogenesis complex regulates the expansion of cilia-derived light-sensing organelles, the rod outer segments, via post-Golgi rhodopsin transport carriers (RTCs). Rabin8 (also known as RAB3IP), an effector of Rab11 proteins and a nucleotide exchange factor (GEF) for Rab8 proteins, is phosphorylated at S272 by NDR2 kinase (also known as STK38L), the canine early retinal degeneration (erd) gene product linked to the human ciliopathy Leber congenital amaurosis (LCA). Here, we define the step at which NDR2 phosphorylates Rabin8 and regulates Rab11-to-Rab8 succession in Xenopus laevis transgenic rod photoreceptors expressing human GFP-Rabin8 and its mutants. GFP-Rabin8 accumulated with endogenous Rabin8 at the Golgi-apposed exit sites (GESs), also known as the trans-Golgi network (TGN). Rabin8 mutants deficient in Rab11 binding prevented membrane association of GFP-Rabin8. GFP-Rabin8 and NDR2 kinase both interacted with the RTC-associated R-SNARE VAMP7 at the trans-Golgi and the GESs. Here, GFP-Rabin8 and the phosphomimetic GFP-Rabin8-S272E integrated into RTCs, which were subsequently functionalized by Rabin8 Rab8 GEF activity. Non-phosphorylatable GFP-Rabin8-S272A caused significant GES enlargement and deformation, possibly leading to unconventional membrane advancement toward the cilium, bypassing RTCs. Rabin8 phosphorylation loss due to an NDR2 gene disruption thereby likely causes dysfunctional rhodopsin Golgi-to-cilia trafficking underlying retinal degeneration and early-onset blindness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,324

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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