Plasma proteomic profiling of mild cognitive impairment in two cohorts using the NULISAseq CNS Disease panel
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Recently, the development of ultra‐sensitive immunoassays has allowed for the detection, in blood, of proteins related to the pathophysiology of Alzheimer’s disease (AD), with phosphorylated tau (p‐tau) being the most promising. However, current methods are often limited by their ability to measure one analyte, lacking the potential for discovery and inclusion of additional biomarkers with supplemental value. In this pilot study, we explored proteomic changes using the novel NUcleic acid Linked Immuno‐Sandwich Assay (NULISA™) platform, focusing on patients with mild cognitive impairment (MCI). Method In this study, MCI patients with a confirmed Aβ status were recruited from two independent cohorts. A discovery cohort (mean[SD] age, 73.5 [5.5] years; 25 females [62.5%]) was classified by cerebrospinal fluid Aβ42/40 (Aβ+ =28; Aβ‐ =12). For the second cohort (mean[SD] age, 70.7 [7.31] years; 39 females[42.9%]; CDR 0.5), from the TRIAD study, amyloid positron emission tomography was utilized instead (Aβ+ =47; Aβ‐ =44). We performed the NULISAseq CNS Disease Panel measurements on the plasma samples (n=131) in two separate batch analyses. LIMMA models were used to evaluate differential expression of protein NPQ values between the two MCI (Aβ+ Vs. Aβ‐) patient groups, with a total of 121 proteins included in the analysis. Result In the discovery cohort (n=40), only p‐tau217 survived multiple comparison (Log 2 FC, 1.49; P adj <0.001). Further targets were present with a significant unadjusted p‐value (P <0.05) (Figure 1b). In the larger TRIAD cohort (n=91), p‐tau217 (Log 2 FC, 1.29; P adj <0.001), p‐tau231 (Log 2 FC, 0.76; P adj <0.05), p‐tau181 (Log 2 FC, 0.42; P adj <0.05) and GFAP (Log 2 FC, 0.78; P adj <0.05) remained significant after adjusting for multiple testing. Similarly to the discovery cohort, additional targets were identified as significantly changed with an unadjusted p‐value (P<0.05) (Figure 1A). This included PARK7, which was the only target present in both. Conclusion In this study, consisting of two independent groups of MCI patients characterized by Aβ burden, we utilized the NULISAseq CNS Disease Panel to identify dysregulated proteins of the prodromal stage of AD. This novel multiplex technology continues to demonstrate the importance of p‐tau217, p‐tau231, p‐tau181 and GFAP as indicators of cerebral amyloid deposition while offering additional markers that may increase their utility.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».