Synaptic proteins in pre‐symptomatic Alzheimer's disease: genes implicate synaptic biomarkers to the early detection of cognitive decline
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The heterogeneous etiology of “sporadic” Alzheimer’s disease (sAD) includes genetic influences. To better understand synaptic dysfunction in AD pathogenesis, we used protein quantitative train loci (pQTL) assessments and a polygenic risk score (PRS) to examine the relationship between synaptic integrity and longitudinal cognitive performance in the presymptomatic phase of the disease. Method The PREVENT‐AD cohort includes symptom‐free elderly participants at risk of AD because of their family history. A second resource, the Quebec Founder Population (QFP) brain bank, derives from the descendants of the 17th and 18th century French settlers in Eastern Canada. We used Olink Proximity Extension Assays to measure the soluble synaptic proteins ADAM 22 (post‐synaptic) and ADAM23 (pre‐synaptic) in 120 CSFs, while immunoprecipitated SYT1 (pre‐synaptic) and SNAP25 (pos‐synaptic) were analyzed in 141 CSF samples using a quadrupole–orbitrap mass spectrometer. The Repeatable Battery for Assessment of Neuropsychological Status (RBANS) indicated cognitive trajectory. Genotyping was performed using the Illumina Infinium Omni 2.5M‐8 array. Cortical RNAs (n=86) from the QFP cohort were processed using GeneChip WT Pico Kit. Statistical analyses included sex, education and APOE e4 status as covariates. Result Among PREVENT‐AD participants who remained cognitively unimpaired over the past 11 years, we observed significant correlations between a PRS constructed from pQTL ADAM 22 CSF concentrations and delayed memory (R2 = 0.06, p = 0.0132), visuospatial constructional memory (R2 = 0.274, p = 0.00408) and total index scale (R2 = 0.202, p = 0.0454), but only trend‐levels association with immediate memory (R2 = 0.1, p = 0.0747). We also found similar correlations between PRS constructed from of CSF ADAM 23, CSF SYT1, CSF SNAP25 concentrations and the different RBANS subscales. Significantly lower cortical mRNA levels for ADAM22 (p = 0.062), ADAM23 (p = 0.0030), SYT1 (p = 0.033) and SNAP25 (p = 0.0036) were found in the autopsied AD brains compared to autopsied control brains. Conclusion CSF synaptic protein levels show promising correlations with emerging cognitive deficits and provide insights toward a possible compensatory mechanism in the early presymptomatic phase of the disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».