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Enregistrement W4406201544 · doi:10.1126/science.adn7954

Local genetic adaptation to habitat in wild chimpanzees

2025· article· en· W4406201544 sur OpenAlexaff
Harrison J. Ostridge, Claudia Fontsere, Esther Lizano, Daniela C. Soto, Joshua M. Schmidt, Vrishti Saxena, Marina Álvarez-Estapé, Christopher D. Barratt, Paolo Gratton, Gaëlle Bocksberger, Jack D. Lester, Paula Dieguez, Anthony Agbor, Samuel Angedakin, Alfred Kwabena Assumang, Emma Bailey, Donatienne Barubiyo, Mattia Bessone, Gregory Brazzola, Rebecca Chancellor, Heather Cohen, Charlotte Coupland, Emmanuel Danquah, Tobias Deschner, Laia Dotras, Jef Dupain, Villard Ebot Egbe, Anne‐Céline Granjon, Josephine Head, Daniela Hedwig, Veerle Hermans, R. Adriana Hernández‐Aguilar, Kathryn J. Jeffery, Sorrel Jones, Jessica Junker, Parag Kadam, Michael T. Kaiser, Ammie K. Kalan, Mbangi Kambere, Ivonne Kienast, Deo Kujirakwinja, Kevin E. Langergraber, Juan Lapuente, Bradley Larson, Anne Laudisoit, Kevin Lee, Manuel Llana, Giovanna Maretti, Rumen Martín, Amelia Meier, David Morgan, Emily Neil, Sonia Nicholl, Stuart Nixon, Emmanuelle Normand, Christopher Orbell, Lucy Jayne Ormsby, Robinson Orume, Liliana Pacheco, Jodie Preece, Sébastien Regnaut, Martha M. Robbins, Aaron Rundus, Crickette Sanz, Lilah Sciaky, Volker Sommer, Fiona A. Stewart, Nikki Tagg, Luc Roscelin Dongmo Tédonzong, Joost van Schijndel, Elleni Vendras, Erin G. Wessling, Jacob Willie, Roman M. Wittig, Yisa Ginath Yuh, Kyle Yurkiw, Linda Vigilant, A. Piel, Christophe Boesch, Hjalmar S. Kühl, Megan Y. Dennis, Tomàs Marquès‐Bonet, Mimi Arandjelovic, Aida M. Andrés

Notice bibliographique

RevueScience · 2025
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePrimate Behavior and Ecology
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilNational Institute of Mental HealthBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésAdaptation (eye)BiologyEndangered speciesGenetic diversityEcologyHabitatEvolutionary biologyWoodlandPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

How populations adapt to their environment is a fundamental question in biology. Yet, we know surprisingly little about this process, especially for endangered species, such as nonhuman great apes. Chimpanzees, our closest living relatives, are particularly notable because they inhabit diverse habitats, from rainforest to woodland-savannah. Whether genetic adaptation facilitates such habitat diversity remains unknown, despite it having wide implications for evolutionary biology and conservation. By using newly sequenced exomes from 828 wild chimpanzees (388 postfiltering), we found evidence of fine-scale genetic adaptation to habitat, with signatures of positive selection in forest chimpanzees in the same genes underlying adaptation to malaria in humans. This work demonstrates the power of noninvasive samples to reveal genetic adaptations in endangered populations and highlights the importance of adaptive genetic diversity for chimpanzees.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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