A Transcriptomic Signature of Depressive Symptoms in Late Life
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Depressive symptoms in late-life can impair daily function and accompany cognitive decline. However, the molecular mechanisms underlying these changes in the brain remain poorly understood. Differential expression analysis was performed on bulk tissue RNA sequencing data generated from dorsolateral prefrontal cortex samples of elderly participants in the Religious Orders Study and Memory and Aging Project (ROS/MAP: n=998, age at death mean=89.6). Bulk tissue RNA sequencing was analyzed against depressive symptoms measured prior to death, controlling for Alzheimer’s disease (AD) neuropathology, medication status, and lifestyle factors. Sex-stratified models were also tested. Increased abundance of the Prader-Willi syndrome-associated gene, PWAR1 (corrected p =5.47x10 -3 ) and CTDSPL2 (corrected p =0.03) were associated with a higher burden of depressive symptoms in the combined sample. An additional 14 genes showed suggestive associations, including several with known links to neuropsychiatric illness (e.g. ACVR2B-AS1, COL19A1) . Functional enrichment analysis revealed downregulation of aerobic metabolism and upregulation of both amino acid catabolism and DNA modification processes. Differential expression signatures were poorly correlated between males and females (Pearson r=0.12; 95%CI = [0.10,0.13]), and only the male group showed independently significant differential expression. Little overlap was found with previously published analyses of major depressive disorder. Building upon recently-published single-nucleus profiling, we present the largest-ever study of transcriptomic correlates of depressive symptoms in late-life, revealing new insights into sex-specific regulators. PWAR1 and CTDSPL2 were identified as putative markers of late-life depression in dorsolateral prefrontal cortex and warrant further study.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle