Plasma proteome profile of Lewy body pathology‐positive individuals
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Lewy bodies (LB), the main hallmark of Parkinson’s disease (PD), are a frequent co‐pathology in Alzheimer’s disease (AD) and dementia with Lewy bodies (DLB). The varying extents of LB pathology in these disorders can influence disease progression and severity. Consequently, understanding LB impact on the proteomic profile of these diseases is crucial, potentially leading to identifyng novel blood biomarkers related to this pathology which are urgently needed. The aim of this project was to assess novel NULISAseq™ α‐synuclein (αSyn) biomarkers in blood. Considering the prevalence of monomeric αSyn in blood, we investigated whether other plasma proteins identified via NULISAseq™ or protein models could serve as surrogates for LB pathology determined by real‐time quake‐inducing conversion seed amplification assay (SAA). Method The proteomic profile of two independent cohorts was assessed using the NULISAseq™ CNS Disease Panel (Alamar Biosciences). A pilot cohort included amyloid‐β (Aβ)‐positive and SAA‐negative AD patients (n = 30) and Aβ‐negative SAA‐positive patients (DLB, n = 22; PD, n = 2). The TRIAD cohort included young (n = 32), cognitively unimpaired Aβ‐positive and Aβ‐negative (CU+, n = 111; CU‐, n = 26) individuals, Aβ‐positive and Aβ‐negative mild cognitive impairment (MCI+, n = 40; MCI‐, n = 39), as well as AD dementia (ADD, n = 38) and non‐AD (n = 27) patients. LB pathology was confirmed in both cohorts by the same SAA method. Result In the pilot cohort, no differences in plasma αSyn (SNCA, pSyn129, Oligo‐Syn) levels were observed. However, plasma phosphorylated tau‐217 (pTau‐217, logFoldChange (FC) = ‐1.00, p.adj<0.001), enolase‐2 (ENO2, logFC = ‐2.03, p.adj = 0.02), Fms Related Receptor Tyrosine Kinase 1 (FLT1, logFC = 0.54, p.adj = 0.04), and amyloid‐β42 (Aβ42, logFC = 1.09, p.adj = 0.04) were differentially expressed in SAA‐negative vs SAA‐positive patients. Furthermore, the ratio of pTau‐217/FLT1 exhibited the best separation between the SAA‐positive and SAA‐negative groups (AUC = 0.90, 95% CI 0.82‐0.98). The TRIAD cohort was used to validate these results, from which data is to be shown. Conclusion The proteomic profile of LB‐positive is distinct from LB‐negative individuals, with four biomarkers differentially expressed in plasma. We also determined that a combination of these biomarkers may be useful to discriminate SAA‐positive from SAA‐negative individuals. Plasma αSyn levels did not reflect CSF SAA outcome, possibly due to peripheral αSyn expression not reflecting brain pathology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».