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Enregistrement W4406222929 · doi:10.1002/alz.095286

Associations between <i>CYP4F2</i> missense variant rs3093105 A&gt;C and Alzheimer’s disease phenotypes

2024· article· en· W4406222929 sur OpenAlexaff
Shiropa Noor, Daniel K Mori‐Fegan, Yuen Yan Wong, Che‐Yuan Wu, Richard J. Roman, Ameer Y. Taha, Walter Swardfager

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEicosanoids and Hypertension Pharmacology
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationPhenotypeAlzheimer's diseaseGeneticsDiseaseBiologyClinical phenotypeMedicineGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background 20‐hydroxyeicosatetranoic acid (20‐HETE) is a potent vasoconstrictor synthesized by the CYP4F2 enzyme. The CYP4F2 missense variant rs3093105 A>C (W12G) has been implicated in hypertension and stroke, risk factors for Alzheimer’s disease (AD), and with decreased 20‐HETE activity. To explore the potential role of the CYP4F2/20‐HETE pathway and AD, this study investigated associations between the rs3093105 variant and AD phenotypes. Method Participants from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative with amyloid‐beta 42 positive PET status and a diagnosis of AD or mild cognitive impairment were selected. Linear regressions explored the relationship between rs3093105 C‐allele carrier status (AC/CC vs AA) and cognition, assessed as executive function and memory composites and Rey Auditory Verbal Learning Test (RAVLT) scores; and brain volumetric measures at baseline, obtained using FreeSurfer on MRI T1‐weighted images. Longitudinal associations (up to 48 months) were explored via interactions between carrier status and time in mixed effects models. Covariates included baseline age, sex, APOE e4 status, years of education, intracranial volume, and Mini Mental State Exam score. Result The rs3093105 variant was present at a minor allele frequency of 19.2% in 315 individuals (mean age 73.3 ± 7.57, 43.2% women). At baseline, C‐allele carriers had higher executive function composite scores (B = 0.315, SE = 0.119, p = 0.009, n = 315) and RAVLT immediate (sum of trials 1‐5) scores (B = 2.46, SE = 1.24, p = 0.048, n = 315), and larger whole brain volume (B = 14.19, SE = 6.84, p = 0.039, n = 310). Over time, carriers had higher memory composite scores (B = 0.116, SE = 0.052, p = 0.027, n = 183) and RAVLT learning (trial 5 minus trial 1) scores (B = 0.484, SE = 0.207, p = 0.021, n = 179), and retention in hippocampal volume (B = 4.19, SE = 1.71, p = 0.016, n = 127). Conclusion Altogether, rs3093105 C‐allele carriers show better performance on memory tests and retention of hippocampal volume. These findings suggest a potential role of the CYP4F2/20‐HETE pathway in AD progression and warrants replication studies in other cohorts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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