Genome‐Wide Associations of Cognitive Domains and their Correlation with Polygenic Risk Scores for Antidepressant Response in Late‐Life Depression
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Late‐life depression (LLD) often coincides with cognitive decline, impacting antidepressant treatment outcomes. Investigating the genetic profile of cognitive function and its association with antidepressant response in individuals with LLD is crucial. Method In the Incomplete Response in Late‐Life Depression: Getting to Remission (IRL‐GRey) study, 307 older adults with major depressive disorder underwent 12‐week venlafaxine treatment. A genome‐wide association study (GWAS) of five cognitive domains using the Repeatable Battery for the Assessment of Neuropsychological Status (RBANS) was conducted. Functional annotations were performed using FUMA. Polygenic risk scores (PRSs) for antidepressant non‐remission and symptom improvement were using PRSice v2. Associations between PRSs and cognitive domains were analyzed, adjusting for age, sex, and genomic principal components. Bonferroni correction and permutation tests were applied to address multiple testing issues. Result Out of the five cognitive domains, significant SNPs were identified for the attention domain (lead SNP rs67854110, beta = ‐9.91, CI = [‐13.12, ‐6.70], P = 4.4e −09 ). Top suggestive genes associated with language showed differential expression in the hypothalamus, cortex, and nucleus accumbens (P bon = 0.001). The language gene set analysis exhibited significant enrichment with the GWAS Catalog set response to cognitive‐behavioral therapy in depression (P = 9.24e −11 ). Additionally, the top SNP associated with delayed memory (rs13087568, beta = ‐8.24, CI = [‐11.36, ‐5.11], P = 4.5e −07 ) was previously linked to depressive symptoms by other studies. Polygenic risk scores (PRS) for non‐remission negatively correlated with attention (P Threshold = 0.0001, N SNPS = 39, OR = 0.105 [0.016, 0.686], P = 0.019), immediate memory (P Threshold = 0.001, N SNPS = 320, OR = 0.074 [0.011, 0.490], P = 0.0072), and delayed memory (P Threshold = 0.01, N SNPS = 2449, OR = 0.107 [0.021, 0.540], P = 0.0074). PRS for symptom improvement showed a positive correlation with delayed memory (PThreshold = 0.001, N SNPS = 385, OR = 5.329 [1.056, 26.885], P = 0.044). However, none of the PRS associations survived the Bonferroni threshold. Conclusion These findings suggest a genetic link between cognitive domains and antidepressant response in LLD, reinforcing previous associations. Understanding genetic contributions to cognitive decline in older adults with depression could aid in early identification and interventions to prevent dementia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».