Severe neonatal hypotonia due to <scp><i>SLC30A5</i></scp> variant affecting function of <scp>ZnT5</scp> zinc transporter
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The tightly‐regulated spatial and temporal distribution of zinc ion concentrations within cellular compartments is controlled by two groups of Zn 2+ transporters: the 14‐member ZIP/SLC39 family, facilitating Zn 2+ influx into the cytoplasm from the extracellular space or intracellular organelles; and the 10‐member ZnT/SLC30 family, mobilizing Zn 2+ in the opposite direction. Genetic aberrations in most zinc transporters cause human syndromes. Notably, previous studies demonstrated osteopenia and male‐specific cardiac death in mice lacking the ZnT5/ SLC30A5 zinc transporter, and suggested association of two homozygous frameshift SLC30A5 variants with perinatal mortality in humans, due to hydrops fetalis and hypertrophic cardiomyopathy. We set out to decipher the molecular basis of a severe hypotonia syndrome. Combining homozygosity mapping and exome sequencing studies of consanguineous Bedouin kindred, as well as transfection experiments and zinc monitoring in HEK293 cells, we demonstrate that a bi‐allelic in‐frame 3bp deletion variant in SLC30A5 , deleting isoleucine within the highly conserved cation efflux domain of the encoded ZnT5, results in lower cytosolic zinc concentrations, causing a syndrome of severe non‐progressive neonatal axial and limb hypotonia with high‐arched palate and respiratory failure. There was no evidence of hydrops fetalis, cardiomyopathy or multi‐organ involvement. Affected infants required nasogastric tube or gastrostomy feeding, suffered from various degrees of respiratory compromise and failure to thrive and died in infancy. Thus, a biallelic variant in SLC30A5 (ZnT5), affecting cytosolic zinc concentrations, causes a severe hypotonia syndrome with respiratory insufficiency and failure to thrive, lethal by 1 year of age.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».