Development and Validation of Natural Language Processing (NLP)‐Based Risk Prediction Model for Cognitive Impairment in Geriatric Patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Dementia poses a significant global crisis, yet 60% of cases go undetected, particularly among specific sub‐populations. Timely diagnosis is crucial for implementing early intervention strategies. Challenges of current screening tools (e.g., Montreal Cognitive Assessment (MOCA) and Mini‐mental Status Exam (MMSE)) include their rule‐based nature, time‐consuming administration and potential bias against individuals with lower education or different socioeconomic backgrounds. Method In this study, we created a patient cohort within Mount Sinai Health System, identifying individuals at high‐risk for cognitive impairment using MMSE scores 23 and below. Extracting clinical notes from inpatient and outpatient settings, we applied specific sampling logic to select the last five notes for each patient before their MMSE. Utilizing word‐embedding techniques, we vectorized sentences and input these vectors into a deep neural network for Named Entity Recognition to extract clinical concepts (e.g diagnosis, signs and symptoms, medications). A psychiatrist reviewed and selected 337 features based on their frequency in the cohort and clinical relevance. Using these features, we created a map to generate feature vectors, and following a train‐test split, 70% of the data was used to train a classifier using the random forest algorithm. The remaining 30% of the cohort was employed for validation purposes. Result Out of 4,366 patients, with documented MMSE scores from 2011 to 2023, 73% had one MMSE, and 29% scored below 24. The developed model demonstrated an AUC ROC of 0.93. At a threshold of 0.5, it showed a sensitivity of 0.86 and specificity of 0.85 in the validation set. On the test set, the AUC ROC was 0.68, with a sensitivity of 0.62 and specificity of 0.63 at a threshold of 0.5. Conclusion The development and validation of this digital tool exemplify translational research that leverages Real‐World Data (RWD) from EMR. The tool aims to assist clinicians in efficient dementia detection across different stages of the disease. Our next phase involves optimizing the feature engineering, fine‐tune the model, and deploying it in the production environment. This will facilitate automated screening of geriatric patients during clinical encounters at Mount Sinai Hospital, allowing us to measure the tool’s prospective performance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».