OAS1: A Protective Mechanism for Alzheimer’s Disease? An Exploration of Data and Possible Mechanisms
Notice bibliographique
Résumé
The immune system and neuroinflammation are now well established in the aetiology of neurodegeneration. Previous studies of transcriptomic and gene association studies have highlighted the potential of the 2′–5′ oligoadenylate synthetase 1 (OAS1) to play a role in Alzheimer’s disease. OAS1 is a viral response gene, interferon-induced, dsRNA activated enzyme, which binds RNase L to degrade dsRNA, and has been associated with COVID-19 response. This study explores whether a viral defence gene could play a vital role in neurodegeneration pathology. The genotyping of five SNPs across the OAS1 locus was conducted in the Brains for Dementia Research (BDR) Cohort for association with AD. RNA-sequencing data were explored for differences in OAS1 gene expression between phenotypes and genotypes. Finally, levels of dsRNA were measured in control cell lines, prior to and after exposure to amyloid oligomers and in cells harbouring a dementia-relevant mutation. No association of any of the OAS1 SNPs investigated were associated with the AD phenotype in the BDR cohort. However, gene expression data supported the previous observation that the minor allele haplotype was associated with higher levels of the OAS1 gene expression and the presence of an alternative transcript. Further to this, the presence of endogenous dsRNA was found to increase with exposure to amyloid oligomers and in the cell line with a dementia-relevant mutation. The data presented here suggest further exploration of the OAS1 gene in relation to dementia is warranted. Investigations of whether carriers of the protective OAS1 haplotype lower dsRNA presence and in turn lower inflammation and cell death are required to support the role of the gene as a moderator of neurodegeneration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».