Screening the human miRNA interactome reveals coordinated up-regulation in melanoma, adding bidirectional regulation to miRNA networks
Notice bibliographique
Résumé
Cellular protein expression is coordinated posttranscriptionally by an intricate regulatory network. The current presumption is that microRNAs (miRNAs) work by repression of functionally related targets within a system. In recent work, up-regulation of protein expression via direct interactions of messenger RNA with miRNA has been found in dividing cells, providing an additional mechanism of regulation. Herein, we demonstrate coordinated up-regulation of functionally coupled proteins by miRNA. We focused on CD98hc, the heavy chain of the amino acid transporter LAT-1, and α-2,3-sialyltransferases ST3GAL1 and ST3GAL2, which are critical for CD98hc stability in melanoma. Profiling miRNA regulation using our high-throughput miRFluR assay, we identified miRNA that up-regulated the expression of both CD98hc and either ST3GAL1 or ST3GAL2. These co-up-regulating miRNAs were enriched in melanoma datasets associated with transformation and progression. Our findings add co-up-regulation by miRNA into miRNA regulatory networks and add a bidirectional twist to the impact miRNAs have on protein regulation and glycosylation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».