Thyroidiomics: An Automated Pipeline for Segmentation and Classification of Thyroid Pathologies from Scintigraphy Images
Notice bibliographique
Résumé
The objective of this study was to develop an automated pipeline that enhances thyroid disease classification using thyroid scintigraphy images, aiming to decrease assessment time and increase diagnostic accuracy. Anterior thyroid scintigraphy images from 2,643 patients were collected and categorized into diffuse goiter (DG), multinodal goiter (MNG), and thyroiditis (TH) based on clinical reports, and then segmented by an expert. A Residual UNet (ResUNet) model was trained to perform auto-segmentation. Radiomic features were extracted from both physician (scenario 1) and ResUNet segmentations (scenario 2), followed by omitting highly correlated features using Spearman's correlation, and feature selection using Recursive Feature Elimination (RFE) with eXtreme Gradient Boosting (XGBoost) as the core. All models were trained under a leave-one-center-out cross-validation (LOCOCV) scheme. Segmentation performance was assessed using the Dice similarity coefficient (DSC), while classification performance was assessed using metrics, such as precision, recall, F1-score, accuracy, area under the Receiver Operating Characteristic (ROC AUC), and area under the precision-recall curve (PRC AUC). ResUNet achieved DSC values of <tex xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">$0.84\pm 0.03,0.71\pm 0.06$</tex>, and <tex xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">$0.86\pm 0.02$</tex> for MNG, TH, and DG, respectively. Classification in scenario 1 achieved an accuracy of <tex xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">$0.76\pm 0.04$</tex> and a ROC AUC of <tex xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">$0.92\pm 0.02$</tex> while in scenario 2, classification yielded an accuracy of <tex xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">$0.74\pm 0.05$</tex> and a ROC AUC of <tex xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">$0.90\pm 0.02$</tex>. The automated pipeline demonstrated comparable performance to physician segmentations on several classification metrics across different classes, effectively reducing assessment time while maintaining high diagnostic accuracy. The code is available at: https://github.com/ahxmeds/thyroidiomics.git.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».