Regulation of stress granule maturation and dynamics by poly(ADP-ribose) interaction with PARP13
Notice bibliographique
Résumé
Non-covalent interactions of poly(ADP-ribose) (PAR) facilitate condensate formation, yet the impact of these interactions on condensate properties remains unclear. Here, we demonstrate that PAR-mediated interactions through PARP13, specifically the PARP13.2 isoform, are essential for modulating the dynamics of stress granules—a class of cytoplasmic condensates that form upon stress, including types frequently observed in cancers. Single amino acid mutations in PARP13, which reduce its PAR-binding activity, lead to the formation of smaller yet more numerous stress granules than observed in the wild-type. This fragmented stress granule phenotype is also apparent in PARP13 variants with cancer-associated single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that disrupt PAR binding. Notably, this fragmented phenotype is conserved across a variety of stresses that trigger stress granule formation via diverse pathways. Furthermore, this PAR-binding mutant diminishes condensate dynamics and impedes fusion. Overall, our study uncovers the important role of PAR-protein interactions in stress granule dynamics and maturation, mediated through PARP13. Stress granules, cellular structures essential for stress response, require poly(ADP-ribose) as a multivalent scaffold. Here, the authors show that disrupting poly(ADP-ribose) binding to PARP13 alters granule size, dynamics, and maturation, despite PARP13 lacking ADPribosyltransferase activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».