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Enregistrement W4406341500 · doi:10.1111/nph.20384

The aerial epidermis is a major site of quinolizidine alkaloid biosynthesis in narrow‐leafed lupin

2025· article· en· W4406341500 sur OpenAlexaff
Karen Frick, Marcus Daniel Brandbjerg Bohn Lorensen, Nikola Mićić, Eddi Esteban, Asher Pasha, Alexander Schulz, Nicholas J. Provart, Hussam Hassan Nour‐Eldin, Nanna Bjarnholt, Christian Janfelt, Fernando Geu‐Flores

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotanical Research and Chemistry
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsNovo Nordisk FondenDanmarks Frie ForskningsfondCarlsbergfondet
Mots-clésQuinolizidineAlkaloidEpidermis (zoology)BiologyBotanyBiosynthesisEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lupins are promising protein crops that accumulate toxic quinolizidine alkaloids (QAs) in the seeds, complicating their end-use. QAs are synthesized in green organs (leaves, stems, and pods) and a subset of them is transported to the seeds during fruit development. The exact sites of biosynthesis and accumulation remain unknown; however, mesophyll cells have been proposed as sources, and epidermal cells as sinks. We investigated the exact sites of QA biosynthesis and accumulation in biosynthetic organs of narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius) using mass spectrometry-based imaging (MSI), laser-capture microdissection coupled to RNA-Seq, and precursor feeding studies coupled to LC-MS and MSI. We found that the QAs that accumulate in seeds ('core' QAs) were evenly distributed across tissues; however, their esterified versions accumulated primarily in the epidermis. Surprisingly, RNA-Seq revealed strong biosynthetic gene expression in the epidermis, which was confirmed in leaves by quantitative real-time polymerase chain reaction. Finally, feeding studies using a stably labeled precursor showed that the lower leaf epidermis is highly biosynthetic. Our results indicate that the epidermis is a major site of QA biosynthesis in narrow-leafed lupin, challenging the current assumptions. Our work has direct implications for the elucidation of the QA biosynthesis pathway and the long-distance transport network from source to seed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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