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Enregistrement W4406347283 · doi:10.1371/journal.pone.0316810

The impact of tuberculosis-induced hyperglycemia on pulmonary microbiota and airway mucus secretion in individuals not previously diabetic: A systematic review and meta-analysis protocol

2025· review· en· W4406347283 sur OpenAlexaboutno aff
Victor Moses Musyoki, Marianne Mureithi, Annamari Heikinheimo, Elizabeth Maleche‐Obimbo, Kariuki Njaanake, Omu Anzala

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisMucusMedicineAirwayTuberculosisSecretionDiabetes mellitusBioinformaticsImmunologyInternal medicineBiologyPathologyEndocrinologySurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lung environment harbours a community of microbes that play a significant role in health and disease, including innate protection against pathogenic microorganisms. Infection with Mycobacterium tuberculosis, psychological stress associated with the tuberculosis (TB) disease, and the metabolites from the rifampicin treatment regimen have been reported to induce hyperglycemia and consequently type 2 diabetes mellitus (T2DM) in individuals not previously diabetic. The high glucose concentration is proposed to alter the composition of the lung microbiota and airway homeostasis, exerting an influence on TB disease and treatment outcomes. In this systematic review, we propose to synthesize literature on TB-induced hyperglycemia and its impact on lung microbiota and secretion of airway mucus in individuals not previously diabetic. A systematic search will be carried out on PubMed, EMBASE, MEDLINE, PROQUEST, Cochrane, SCOPUS, and manually on Google Scholar and references of relevant articles to identify other studies. We will review published articles that include studies on TB-induced hyperglycemia, pulmonary microbiome, mucin secretion, and (or) airway surface liquid upon TB diagnosis and during treatment. The quality of the study articles will be assessed using the modified Newcastle-Ottawa Scale (NOS). Meta-analysis will be conducted using random effect model for heterogeneity to pool estimates on microbial diversity. Egger's test will be performed to explore any selective reporting bias. The findings of the systematic review and the meta-analysis will be reported as per the Preferred Reporting Items for Systematic Review and Meta-Analysis (PRISMA) protocol guidelines. This protocol was developed and uploaded onto the International Prospective Register of Systematic Reviews (PROSPERO) database, registration number: CRD42024482248.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,045
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,059
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,240

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0450,059
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0250,033
Bibliométrie0,0150,011
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0060,006
Science ouverte0,0060,006
Intégrité de la recherche0,0060,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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