Sequential emergence and quantitative dynamics of key bacterial species preceding digital dermatitis lesion onset in dairy cattle
Notice bibliographique
Résumé
Digital dermatitis (DD) is a skin infection of cattle's feet with multiple bacteria suspected to be involved, yet its precise etiopathogenesis remains unclear. This longitudinal study explored the temporal changes of seven DD-associated bacteria in feet developing lesions or remaining healthy, while simultaneously investigating their persistence in potential reservoirs as sources of infection. Weekly swabs were collected from feet skin and saliva of 53 Holstein cows without DD lesions sequentially enrolled at calving in a commercial dairy herd. At the end of the study, samples from all cases and a subset of matched controls were analyzed (1:2 ratio) at five-time points (weeks -3, -2, -1, 0 - when early signs of DD were observed - and +1) and subjected to qPCR targeting Treponema phagedenis, T. medium, T. pedis, Porphyromonas levii, Bacteroides pyogenes, Fusobacterium necrophorum, and F. mortiferum. Linear mixed-effect models assessed the bacterial number changes within cows (cases) and between cows (cases vs controls). Throughout the study, 8 cows developed signs of DD. P. levii, F. necrophorum, and B. pyogenes numbers increased two weeks before the first visible lesion. T. phagedenis and T. pedis numbers increased one week before, suggesting a sequential colonization and potential synergism in triggering DD. Only P. levii and F. necrophorum were persistently present in saliva and skin, while Treponema spp. persisted solely in lesions. Our results inform specific bacterial dynamics associated with DD pathogenesis and might advise future attempts to effectively treat and control DD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».