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Enregistrement W4406365506 · doi:10.1002/9781683670438.cmph0112

Clinical Breakpoints and Epidemiological Cutoff Values

2023· other· en· W4406365506 sur OpenAlexaff
Philippe J. Dufresne, Jeff Fuller

Notice bibliographique

RevueClinMicroNow · 2023
Typeother
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreSte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCutoffBreakpointEpidemiologyComputational biologyMedicineComputer scienceBiologyGeneticsPhysicsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Interpreting the value of in vitro susceptibility test results relies not only on the quality and standardization of test methods but also on the quality and standardization of the methods used to derive interpretive thresholds. Clinical breakpoints (CBPs) are developed from a collection of in vitro and in vivo data so that the interpretation of a susceptibility test result correlates with the likelihood of a good patient outcome. Epidemiological cutoff values, which categorize MIC values as wild‐type or non‐wildtype, are developed strictly from in vitro MIC data and correlate with the likelihood of a cultured isolate harboring an acquired mechanism of resistance to the tested antimicrobial agent. Clinical and Laboratory Standards Institute CBPs have been developed for the echinocandins, fluconazole, and voriconazole against the more common species of Candida as well as for voriconazole against Aspergillus fumigatus . EUCAST provides CBPs for yeasts and molds for susceptibility testing performed according to its broth microdilution protocol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,060
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,088

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,060
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0110,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0260,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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