Depression symptom-specific genetic associations in clinically diagnosed and proxy case Alzheimer’s disease
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Depression is a risk factor for the later development of Alzheimer’s disease (AD), but evidence for the genetic relationship is mixed. Assessing depression symptom-specific genetic associations may better clarify this relationship. To address this, we conducted genome-wide meta-analysis (a genome-wide association study, GWAS) of the nine depression symptom items, plus their sum score, on the Patient Health Questionnaire (PHQ-9) (GWAS-equivalent N : 224,535–308,421) using data from UK Biobank, the GLAD study and PROTECT, identifying 37 genomic risk loci. Using six AD GWASs with varying proportions of clinical and proxy (family history) case ascertainment, we identified 20 significant genetic correlations with depression/depression symptoms. However, only one of these was identified with a clinical AD GWAS. Local genetic correlations were detected in 14 regions. No statistical colocalization was identified in these regions. However, the region of the transmembrane protein 106B gene ( TMEM106B ) showed colocalization between multiple depression phenotypes and both clinical-only and clinical + proxy AD. Mendelian randomization and polygenic risk score analyses did not yield significant results after multiple testing correction in either direction. Our findings do not demonstrate a causal role of depression/depression symptoms on AD and suggest that previous evidence of genetic overlap between depression and AD may be driven by the inclusion of family history-based proxy cases/controls. However, colocalization at TMEM106B warrants further investigation.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle