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Enregistrement W4406400880 · doi:10.1038/s44220-024-00369-0

Depression symptom-specific genetic associations in clinically diagnosed and proxy case Alzheimer’s disease

2025· article· en· W4406400880 sur OpenAlex
Lachlan Gilchrist, Thomas P Spargo, Rebecca Green, Jonathan R. I. Coleman, David M. Howard, Jackson G. Thorp, Brett N. Adey, Jodie Lord, Helena L. Davies, Jessica Mundy, Abigail ter Kuile, Molly R. Davies, Christopher Hübel, Shannon Bristow, Sang Hyuck Lee, Henry C. Rogers, Charles Curtis, Saakshi Kakar, Chelsea Mika Malouf, Gursharan Kalsi, Ryan Arathimos, Anne Corbett, Clive Ballard, Helen Brooker, Byron Creese, Dag Aarsland, Adam Hampshire, Latha Velayudhan, Thalia C. Eley, Gerome Breen, Alfredo Iacoangeli, Sulev Kõks, Cathryn M. Lewis, Petroula Proitsi

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueNature Mental Health · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingNIHR Maudsley Biomedical Research CentreMultiple Sclerosis Society of Western AustraliaMedical Research CouncilServierEuropean CommissionGenentechErasmus Medisch CentrumBundesministerium für Bildung und ForschungEisaiUniversity of Southern CaliforniaFoundation for the National Institutes of HealthCentre hospitalier régional universitaire de LilleRosetrees TrustH. Lundbeck A/SAlzheimer’s Research UKInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNational Institutes of HealthKing's College LondonUniversity of ExeterIXICOUniversity of CambridgeLifeArcMND ScotlandUniversité de LilleNHS Blood and TransplantNational Institute for Health and Care ResearchHjartaverndNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheCanadian Institutes of Health ResearchAlzheimer's SocietyUniversity College LondonWellcome TrustMotor Neurone Disease AssociationSpastic Paraplegia FoundationAlzheimer's AssociationAlfried Krupp von Bohlen und Halbach-StiftungCardiff UniversityEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseDepartment of Health and Social CareMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeEconomic and Social Research CouncilNovartis Pharmaceuticals CorporationDevelopment of Innovative Strategies for a Transdisciplinary approach to ALZheimer's diseaseNIHR BioResourceBristol-Myers Squibb
Mots-clésProxy (statistics)Depression (economics)DiseaseAlzheimer's diseaseMedicinePsychiatryPsychologyClinical psychologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Depression is a risk factor for the later development of Alzheimer’s disease (AD), but evidence for the genetic relationship is mixed. Assessing depression symptom-specific genetic associations may better clarify this relationship. To address this, we conducted genome-wide meta-analysis (a genome-wide association study, GWAS) of the nine depression symptom items, plus their sum score, on the Patient Health Questionnaire (PHQ-9) (GWAS-equivalent N : 224,535–308,421) using data from UK Biobank, the GLAD study and PROTECT, identifying 37 genomic risk loci. Using six AD GWASs with varying proportions of clinical and proxy (family history) case ascertainment, we identified 20 significant genetic correlations with depression/depression symptoms. However, only one of these was identified with a clinical AD GWAS. Local genetic correlations were detected in 14 regions. No statistical colocalization was identified in these regions. However, the region of the transmembrane protein 106B gene ( TMEM106B ) showed colocalization between multiple depression phenotypes and both clinical-only and clinical + proxy AD. Mendelian randomization and polygenic risk score analyses did not yield significant results after multiple testing correction in either direction. Our findings do not demonstrate a causal role of depression/depression symptoms on AD and suggest that previous evidence of genetic overlap between depression and AD may be driven by the inclusion of family history-based proxy cases/controls. However, colocalization at TMEM106B warrants further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle