Prognostic values of molecular subtypes and SWI/SNF protein expression in de‐differentiated/undifferentiated endometrial carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Classification and risk stratification of endometrial carcinoma (EC) has transitioned from histopathological features to molecular classification, e.g. the ProMisE classifier, identifying four prognostic subtypes: POLE mutant (POLEmut) with almost no recurrence or disease-specific death events, mismatch repair deficient (MMRd) and no specific molecular profile (NSMP), with intermediate outcome and p53 abnormal (p53abn) with poor outcomes. However, the applicability of molecular classification is unclear in rare but aggressive histotypes of EC, e.g. de-differentiated and undifferentiated endometrial cancers (DD/UDEC). Here, we aim to assembled a cohort of DD/UDEC from a single institution and analysed the prognostic significance of ProMisE molecular subtypes and the expression of SWItch/sucrose non-fermentable (SWI/SNF) chromatin remodelling complex members, previously implicated in the pathogenesis of DD/UDEC. METHODS AND RESULTS: We accrued 88 DD/UDEC cases, assessed POLE status by Sanger sequencing and performed immunohistochemistry for p53, mismatch repair and SWI/SNF proteins on the tissue microarrays assembled. Assignment of molecular subtypes was possible in 80 tumours; POLE sequencing failed in the remaining eight cases. There were 12 (15%) POLEmut, 44 (55%) MMRd, 14 (17.5%) p53abn and 10 (12.5%) NSMP DD/UDEC. POLEmut DD/UDECs had excellent outcomes, but the other three molecular subtypes all had poor outcomes, with no significant differences among them. The loss of one or more SWI/SNF proteins [AT-rich interactive domain-containing protein 1A (ARID1A), ARID1B, SWI/SNF-related, matrix-associated, actin-dependent regulator of chromatin, subfamily A, member 4 (SMARCA4), SMARCA2], observed in 66% (55 of 83) cases, was not of prognostic significance. CONCLUSIONS: These results indicate that all molecular subtypes of DD/UDEC except POLEmut behave in an aggressive fashion. Further study is needed to determine whether these molecular alterations can be targeted with adjuvant therapy, in order to improve outcomes of patients with DD/UDEC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».