Charge Reversal of the Uppermost Arginine in Sliding Helix S4-I Affects Gating of Cardiac Sodium Channel
Notice bibliographique
Résumé
Several mutations of the uppermost arginine, R219, in the voltage-sensing sliding helix S4I of cardiac sodium channel Nav1.5 are reported in the ClinVar databases, but the clinical significance of the respective variants is unknown (VUSs). AlphaFold 3 models predicted a significant downshift of S4I in the R219C VUS. Analogous downshift S4I, upon its in silico deactivation, resulted in a salt bridge between R219 and the uppermost glutamate, E161, in helix S2I. To understand how salt bridge elimination affects biophysical characteristics, we generated mutant channel R219E, expressed it in the HEK293-T cells, and employed the patch-clamp method in a whole-cell configuration. Mutation R219E did not change the peak current density but shortened time to the peak current at several potentials, significantly enhanced activation, enhanced steady-state inactivation and steady-state fast inactivation, and slowed recovery from inactivation. Taken together, these data suggest that mutation R219E destabilized the resting state of Nav1.5. Cardiac syndromes associated with mutations R219P/H/C/P or E161Q/K are consistent with the observed changes of biophysical characteristics of mutant channel R219E suggesting pathogenicity of the respective VUSs, as well as ClinVar-reported VUSs involving arginine or glutamate in homologous positions of several Nav1.5 paralogs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».