MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4406483235 · doi:10.22541/au.173709381.18225888/v1

Amino acids from root exudates induce Bacillus spore germination to enhance root colonization and plant growth promotion

2025· preprint· en· W4406483235 sur OpenAlexaff
Lili Tao, Xinli Sun, Pascale B. Beauregard, Taimeng Tan, Yuling Zhang, Jiyu Xie, Guidong Huang, Nan Zhang, Youzhi Miao, Qi Shen, Ruifu Zhang, Zhihui Xu

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColonizationGerminationSporeSpore germinationPromotion (chess)Plant growthBotanyBiologyRoot (linguistics)HorticultureMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Strains of Bacillus species, plant growth-promoting rhizobacteria, have been commercialized as biofertilizers; they are ideal for this, because these species form spores that can be stored stably for a long time. However, for these spores to exert their full beneficial effects, they must germinate. The specific germination signals in the rhizosphere, particularly those from plant root exudates, remain largely unknown. Here, we investigated the germination signals from different growth states of cucumber ( Cucumis sativus ) for spores of B. velezensis SQR9 and B. subtilis NCIB 3610. We identified the corresponding germination receptors and compared them biochemically between the Bacillus species. Larger plants better stimulated spore germination. Five amino acids – L-isoleucine, L-ornithine, L-valine, L-serine, and β-alanine – were identified as spore germination signals. Combined application of a mixture of these amino acids with bacterial spores markedly enhanced the cucumber-growth-promoting properties of B. velezensis SQR9. The germination receptor for these amino acids was GerA in both Bacillus spp. Differences in spore germination efficiency between B. subtilis and B. velezensis may be attributable to variations in the GerA ligand-recognition sites. Expression of GerA from B. subtilis NCIB 3610 in B. velezensis SQR9 enhanced the spore germination rate of the latter. Our study highlights the pivotal role of amino acids in regulating spore germination of Bacillus and subsequent plant root colonization, emphasizing their potential to enhance the efficacy of Bacillus -based biofertilizers. Engineering of germination receptors is a promising approach to enhance the spore germination efficiency of biofertilizer strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetLegume Nitrogen Fixing Symbiosis→Travaux en français237 207→