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Enregistrement W4406542041 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-ffb6q

A tale of two mechanisms: The p53 modulator COTI-2 is a Zn metallochaperone

2025· preprint· en· W4406542041 sur OpenAlexafffund
İrem Şimşek, Farsheed Shahbazi‐Raz, Azam Mohammadzadeh, Maryam Kosar, Peihan Xu, Samra Khan, Olena I. Tykhoniuk, Ashley DaDalt, Deya'a Almasri, Lara K. Watanabe, Kaitlyn Breault, John J. Hayward, Fraser S. Pick, Ruoya Ho, Jeremy M. Rawson, John F. Trant

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryBiophysicsPhysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Mutations in, or misregulation of, Tp53 are found in approximately 50% of all cancers. p53 functions by ensuring that cells with irretrievably damaged DNA undergo apoptosis. Tp53 mutations often induce conformational changes that inhibit activity; however, small‐molecule chaperones could theoretically restore conformation and activity. COTI‐2, a thiosemicarbazone with orphan‐drug status for ovarian cancer, has proven an effective cytotoxic agent against various cancer cell lines in vitro , exhibited efficacy in vivo , and has demonstrated a good safety profile in Phase 1b human clinical trials. The proposed mechanism, direct engagement and refolding of mutant p53, has been supported by a combination of cell‐based assays and transcriptomics data. Through a combination of experimental and computational approaches, we demonstrate that this is an unlikely mechanism of action, and that COTI ‐2 instead likely acts as a selective, well‐tolerated, zinc chaperone to replace zinc ions lost to p53 mutants' deficient zinc‐binding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0060,014
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0050,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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