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Enregistrement W4406559981 · doi:10.1016/j.omtn.2025.102452

Redefining NSP12 activity in SARS-CoV-2 and its regulation by NSP8 and NSP7

2025· article· en· W4406559981 sur OpenAlexaff
Deepa Singh, Tushar Kushwaha, Rajkumar Kulandaisamy, Vikas Kumar, Kamal Baswal, Saras H Tiwari, A. K. Ghorai, Manoj Kumar, Saroj Kumar, Soumya De, Polamarasetty Aparoy, Deepak Sehgal, Madhumohan R. Katika, Suresh Gadde, Marceline Côté, Sarala Rani Kayampeta, Mohan Babu Appaiahgari, Krishna Kishore Inampudi

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Nucleic Acids · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesAll-India Institute of Medical SciencesScience and Engineering Research BoardIndian Council of Medical ResearchDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaBiotechnology Industry Research Assistance CouncilDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, India
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakVirologyBetacoronavirusNeuroscienceBiologyCognitive sciencePsychologyMedicineInternal medicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RdRp is a critical component of an RNA virus life cycle. Among coronaviruses, NSP12 , along with one copy of NSP7 and two copies of NSP8 , forms the RdRp holoenzyme and exhibits polymerase activity. While coronavirus RNA replication is sufficiently understood, the interplay among these NSP s and its influence on RNA binding and nascent strand synthesis remains poorly understood. Here, we reconstituted a functional RdRp holoenzyme using recombinant SARS-CoV-2 NSP12 , NSP7 , and NSP8 in vitro . Molecular interactions among NSP s and their effect on the polymerase activity were investigated, wherein NSP12 alone exhibited notable activity, which was further enhanced by the presence of both NSP7 and NSP8 . The presence of only one cofactor, either NSP7 or NSP8 , completely inhibited NSP12 activity and led to RNA template detachment. Computational analyses of different NSP12 complexes suggested that binding of NSP7 or NSP8 alone to NSP12 constricts the RNA entry channel, which was higher in the presence of NSP8 , making it inappropriate for RNA entry/binding. We conclude that NSP7 and NSP8 together synergize to enhance the NSP12 activity, but antagonize when alone. These findings have implications for novel drug development, and compounds inhibiting NSP7 or NSP8 interactions with NSP12 can be lethal to coronavirus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,858

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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