MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4406596235 · doi:10.1016/j.cej.2025.159745

A platinum polymer probe for multiplexed single cell suspension mass cytometry and imaging mass cytometry assays

2025· article· en· W4406596235 sur OpenAlexafffund
Edmond C. N. Wong, Tianjia Yang, Yefeng Zhang, Yang Liu, Daniel Majonis, Mahtab Abtahi, Chen Xu, Xiaochong Li, Peter John Hawrysh, Taunia Closson, Shelly Paluan, Mitchell A. Winnik

Notice bibliographique

RevueChemical Engineering Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFluidigm
Mots-clésMass cytometryFlow cytometryCytometryPlatinumChemistrySuspension (topology)MultiplexingMaterials scienceAnalytical Chemistry (journal)BiophysicsChromatographyMolecular biologyBiologyBiochemistryComputer scienceTelecommunicationsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• A polymer system carrying pendant dipicolylamine chelators that bind Pt 2+ ions was synthesized. • Isotopically enriched Pt polymers were conjugated to antibodies (Abs) and were investigated as reagents for mass cytometry (MC) applications. • The Pt polymer-Ab conjugates were effective probes for antigen detection on cells by suspension MC. • A Pt-polymer-anti-CD45RA conjugate was effective for imaging tissue sections by imaging mass cytometry. • The Pt polymer was compatible with commercial MC reagents and with other Pt isotopes of the same polymer in multiplex cell assays. Single-cell analysis with mass cytometry has enabled routine detection of ∼ 50 biomarkers per cell with suspension mass cytometry (SMC), and 40 + biomarkers in tissue sections with imaging mass cytometry (IMC). However, biologists have expressed the strong need for additional mass tag reagents. While there has been progress in the development of alternative metal mass tags for SMC, few reagents have been validated for IMC. We report polyacrylamide polymers (DP = 22, 55) carrying dipicolylamine (DPA) chelators effective at binding Pt 2+ ions that serve as effective mass tags with strong signal and low nonspecific binding in both SMC and IMC applications. These polymers were labeled with three Pt isotopes ( 195 Pt, 196 Pt, and 198 Pt) and gave excellent performance in an 11-plex SMC assay on peripheral blood mononuclear cells. We further demonstrated that the 196 Pt-polymer was effective at generating sharp images comparable to commercial lanthanide-based reagents when used in a 5-plex IMC assay on healthy human tonsil tissue. We demonstrate that these Pt polymers serve as versatile mass tags that can be conjugated to various Abs and target their respective biomarkers with high specificity for both cell and tissue samples. Our Pt polymer system has higher sensitivity than existing cisplatin-labeled Abs. and increases the accessible mass channels for both SMC and IMC by three. This work also presents the first Pt probe that is demonstrated to be highly effective for imaging of tissue sections by IMC. Overall, these polymers add three new mass tags to the mass cytometry toolbox, and this work presents a valuable contribution toward the design of new mass tag reagents that are suitable for both SMC and IMC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,733
Score d'incertitude au seuil0,930

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueChemical Engineering JournalMême sujetSingle-cell and spatial transcriptomicsTravaux en français237 207