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Enregistrement W4406691163

Recherche et étude d’entomotoxines de type A1b du pois : Application à la protection contre le ravageur de la tomate, Tuta absoluta

2023· dissertation· en· W4406691163 sur OpenAlexfundno aff
Fatima Diya

Notice bibliographique

Revuetheses.fr (ABES) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEntomopathogenic Microorganisms in Pest Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'EnvironnementInstitut National des Sciences Appliquées de LyonUniversité LibanaiseAgence Universitaire de la FrancophonieIndian National Science Academy
Mots-clésTuta absolutaPEST analysisHorticultureBiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Le PA1b (Pea Albumin 1 subunit b, Albumine 1 du pois sous-unité b) est un peptide de 37 acides aminés appartenant à la famille Inhibitory Cystine Knot (=knottin) extrait des graines du pois Pisum sativum. PA1b presente une activité entomotoxique en ciblant la VATP-ase des insectes, une pompe à protons nécessaire à l'absorption des nutriments. La toxicité du PA1b a été demontrée contre certains ravageurs des cultures d’importance économique majeure, mais aussi contre des vecteurs à l’origine d’importantes épidémies amimales, ce qui en fait une alternative interéssante aux insecticides conventionnels. La diversité naturelle de ce peptide a été étudiée dans différentes graines de légumineuses de la famille des Fabacées à l'aide de divers outils moléculaires, biochimiques et bioinformatiques. Dans la première partie de cette thèse, nous avons caractérisé des homologues génomiques du PA1b chez des espèces de la sous-famille des Faboideae originaires du Moyen-Orient afin d'élargir nos connaissances sur la diversité de ce peptide et identifier des molécules A1b à l’activité entomotoxique plus importante. L'activité insecticide des farines obtenues à partir des graines de chaque espèce sélectionnée a été évaluée contre deux souches de charançons des céréales Sitophilus oryzae, un ravageur majeur des denrées stockées. Ces travaux ont permis sélectionner l’espèce Vicia sativa ssp. sativa comme candidat potentiel contenant des isoformes A1b. Nous avons ensuite déterminé les caractéristiques biochimiques et l’activité biologique des isoformes de cette plante provenant de cinq régions géographiques différentes. Les isoformes extraits de Vicia sativa ssp sativa originaire de Turquie ont montré une activité toxique in vivo et in vitro remarquable. Pour cette raison, nous nous sommes focalisés sur cette population afin de caractériser la sequence de l’isoforme A1b la plus toxique, d’un point de vue moléculaire et par spectrométrie de masse. Dans la seconde partie de cette thèse, nous avons etudié AG41, une isoforme A1b precedemment découverte dans les racines de Medicago truncatula et dix fois plus toxique que PA1b. Nous avons determiné la structure tridimensionnelle de AG41 par résonance nucléaire magnétique (RNM) et identifié les principaux résidus responsables de sa toxicité accrue. Enfin, nous avons evalué l'activité de PA1b vis-à-vis de Tuta absoluta, le principal ravageur de la tomate. Le peptide administré par injection s'est révélé létal pour le stade larvaire du ravageur. Cela offre des perspectives intéressantes quant à l’utilisation du PA1b en tant que bio-insecticide dans la lute contre T. absoluta et d’autres insectes nuisibles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,543
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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