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Enregistrement W4406710471 · doi:10.3390/molecules30030472

The Influence of pH on Long-Range Electron Transfer and Proton-Coupled Electron Transfer in Ruthenium-Modified Azurin

2025· article· en· W4406710471 sur OpenAlexafffund
Nikta Ghazi, Jeffrey J. Warren

Notice bibliographique

RevueMolecules · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMetal-Catalyzed Oxygenation Mechanisms
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSimon Fraser University
Mots-clésAzurinElectron transferChemistryRedoxIntramolecular forceRutheniumContext (archaeology)Pourbaix diagramProton-coupled electron transferImidazoleCopper proteinPhotochemistryElectrochemistryComputational chemistryPhysical chemistryInorganic chemistryStereochemistryCopperOrganic chemistryElectrode

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Long-range electron transfer (ET) is an essential component of all biological systems. Reactions of metalloproteins are important in this context. Recent work on protein “charge ladders” has revealed how the redox state of embedded metal ions can influence the ionization of amino acid residues at protein surface sites. Inspired by these observations, we carried out a variable pH investigation of intramolecular ET reactions in a ruthenium-modified protein system built on azurin from Pseudomonas aeruginosa. We also generate a Pourbaix diagram that describes the variable pH redox behavior of a Ru model complex, Ru(2,2′-bipyridyl)2(imidazole)2(PF6)2. The intramolecular ET rate constants for the oxidation of azurin-Cu+ by flash-quench-generated Ru3+ oxidants do not follow the predictions of the semi-classical ET rate expression with fixed values of reorganization energy (λ) and electronic coupling (HDA). Based on the pH dependence of the Ru3+/2+ redox couple, we propose a model where pure ET is operative at acidic pH values (≤ 7) and the mechanism changes to proton-coupled electron transfer at pH ≥ 7.5. The implications of this mechanistic proposal are discussed in the context of biological redox reactions and with respect to other examples of intramolecular ET reactions in the literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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