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Enregistrement W4406712374 · doi:10.1101/2025.01.21.634064

USP1 acts as a chaperone for HSFA2 and plays a crucial role in thermopriming in Arabidopsis

2025· preprint· en· W4406712374 sur OpenAlexaff
Prabhu Manickam, Kirti Shekhawat, Anam Fatima, Hanna Alhoraibi, Aala A. Abulfaraj, Naganand Rayapuram, Heribert Hirt

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensKootenay Association for Science & Technology
Organismes subventionnairesKing Abdullah University of Science and Technology
Mots-clésArabidopsisChaperone (clinical)Cell biologyChemistryBiologyBiochemistryMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plants employ diverse strategies to cope with different types of heat stress. The response to short-term acute heat stress differs significantly from that to moderate heat stress followed by severe stress events. After experiencing moderate heat stress, plants exhibit a more robust response to subsequent severe stress, a phenomenon known as thermopriming or acquired thermotolerance. Thermopriming creates a memory by maintaining the heat stress (HS) memory-related genes in an alert state. In this work, we investigated the role of Arabidopsis Universal Stress Protein 1 (USP1) in plant heat stress responses. CRISPR-Cas9 generated knockout usp1 mutant lines showed no morphological changes during development and normal growth conditions. However, usp1 mutant plants showed enhanced levels of apoplast hydrogen peroxide and superoxide reactive oxygen species accumulation upon heat stress. Transcriptome analyses revealed that genes related to protein folding, electron transport, and oxidative phosphorylation are strongly upregulated in usp1 mutant plants. USP1 is essential for acquired thermotolerance, as usp1 mutants are compromised in heat stress memory but show normal responses to acute heat stress similar to hsfa2 mutants. Biochemical assays showed that USP1 functions as a molecular chaperone, protecting the transcription factor HSFA2 from heat-induced denaturation. Moreover, usp1 mutant plants show decreased transcript levels of heat stress response genes and reduced H3K4me3 enrichment at memory gene loci. These data show that USP1 plays an important role as a chaperone of HSFA2 in mediating plant heat stress memory.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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