MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4406800729 · doi:10.3390/mca30010013

Reduced-Order Model for Cell Volume Homeostasis: Application to Aqueous Humor Production

2025· article· en· W4406800729 sur OpenAlexaff
Riccardo Sacco, Greta Chiaravalli, Giovanna Guidoboni, Anita T. Layton, Gal Antman, Keren Wood Shalem, Alice Verticchio, Brent Siesky, Alon Harris

Notice bibliographique

RevueMathematical and Computational Applications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlaucoma and retinal disorders
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNew York Eye and Ear Infirmary of Mount SinaiResearch to Prevent BlindnessNational Science FoundationNational Institutes of HealthGlaucoma Foundation
Mots-clésChemistryHomeostasisExtracellularBiophysicsVolume (thermodynamics)SodiumCarbonic anhydraseBiochemistryThermodynamicsCell biologyBiologyEnzymePhysicsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of a cell to keep its volume constant irrespective of intra- and extracellular conditions is essential for cellular homeostasis and survival. The purpose of this study is to elaborate a theoretical model of cell volume homeostasis and to apply it to a simulation of human aqueous humor (AH) production. The model assumes a cell with a spherical shape and only radial deformation satisfying the property that the cell volume in rest conditions equals that of the cell couplets constituting the ciliary epithelium of the human eye. The cytoplasm is described as a homogeneous mixture containing fluid, ions, and neutral solutes whose evolution is determined by net production mechanisms occurring in the intracellular volume and by water and solute exchange across the membrane. Averaging the balance equations over the cell volume leads to a coupled system of nonlinear ordinary differential equations (ODEs) which are solved using the θ-method and the Matlab function ode15s. Simulation tests are conducted to characterize the set of parameters corresponding to baseline conditions in AH production. The model is subsequently used to investigate the relative importance of (a) impermeant charged proteins; (b) sodium–potassium (Na+/K+) pumps; (c) carbonic anhydrase (CA) in the AH production process; and (d) intraocular pressure. Results suggest that (a) and (b) play a role; (c) lacks significant weight, at least for low carbon dioxide values; and (d) plays a role for the elevated values of intraocular pressure. Model results describe a higher impact from charged proteins and Na+/K+ ATPase than CA on AH production and cellular volume. The computational virtual laboratory provides a method to further test in vivo experiments and machine learning-based data analysis toward the prevention and cure of ocular diseases such as glaucoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMathematical and Computational ApplicationsMême sujetGlaucoma and retinal disordersTravaux en français237 207