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Enregistrement W4406807090 · doi:10.3390/cells14030177

Analysis of Exon Skipping Applicability for Dysferlinopathies

2025· review· en· W4406807090 sur OpenAlexafffund
Jamie Leckie, Martin Krahn, Toshifumi Yokota

Notice bibliographique

RevueCells · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMuscular Dystrophy CanadaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchMuscular Dystrophy CanadaUniversity of AlbertaAlberta Innovates - Health SolutionsWomen and Children's Health Research InstituteChildren's Health Research InstituteAlberta InnovatesHeart and Stroke Foundation of CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésExon skippingExonComputational biologyBioinformaticsPopulationGeneticsMedicineBiologyGeneAlternative splicing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

gene and treat dysferlinopathies. Understanding the applicability of various exon skipping strategies in the total patient population, an analysis not previously performed, can help guide researchers in prioritizing therapies with the broadest potential impact. Using data from the UMD-DYSF database, we evaluated all reported pathogenic variants in dysferlinopathy patients for the applicability of single- or double-exon skipping approaches to exclude the pathogenic variants while maintaining the open reading frame. A total of 61 theoretically applicable exon skipping strategies were identified, with the potential to address 90.0% of the pathogenic variants reported-44.6% through single-exon skipping and 45.3% through double-exon skipping. The most broadly applicable targets include exons 28 and 29 (9.0%), exons 27 and 28 (6.7%), and exons 50 and 51 (5.4%). While numerous theoretically applicable strategies were identified, it remains unclear if the truncated proteins produced through each exon skipping strategy will have improved functionality to alleviate patient symptoms. Further preclinical studies and clinical trials will be essential to determine the effectiveness of these therapies, potentially expanding access to disease-modifying treatments for dysferlinopathy patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,708

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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