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Enregistrement W4406817228 · doi:10.1101/2025.01.23.25320556

Accuracy of rapid antigen testing for COVID-19 in shelter settings

2025· preprint· en· W4406817228 sur OpenAlexafffundabout
Yasmin Garad, Andreea Manea, Negin Pak, Bronwyn Barker, Danielle Kasperavicius, Lames Danok, Stefan Baral, Aaron Orkin, Amna Siddiqui, Sharon E. Straus, Christine Fahim

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt Joseph's Health CentreSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesHealth Canada
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Virology2019-20 coronavirus outbreakMedicineOutbreakInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The COVID-19 pandemic disproportionally affected congregate living settings, including shelters. COVID-19 transmission can have more adverse outcomes in these settings due to the vulnerability of residents. Point of care rapid antigen testing (RAT) represents a strategy with potential benefits for COVID-19 detection in shelters, including rapid results, ease of use, cost-effectiveness, and early detection. Objectives Our primary objective was to assess the real-world test accuracy of RAT for COVID-19 using the Quidel Sofia 2 Flu + SARS Antigen fluorescent immunoassay (Sofia RAT) compared to polymerase chain reaction (PCR) testing among shelter residents in Ontario, Canada. Study Design A consecutive sample of 102 residents across six shelters who were symptomatic for, or exposed to COVID-19 were included. The RAT and PCR samples were taken on the same day for each participant. Results from the Sofia RAT were compared to PCR test results to determine test accuracy. Participant demographic data could not be collected due to workforce constraints. Results We reported our methods and findings using the QUality Assessment tool of Diagnostic Accuracy Studies (QUADAS-2) guidelines. Sofia 2 RAT specificity was 97.9% (95% CI: 92.7% to 99.7%) for COVID-19 compared to PCR. Due to a lack of true positive cases, sensitivity could not accurately be calculated (0.00% (95% CI: 0.00% to 52.2%)). Conclusion These data suggest that the Sofia RAT is a highly specific test for COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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