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Enregistrement W4406823039 · doi:10.1021/acs.biochem.4c00613

A Noncatalytic Cysteine Residue Modulates Cobalamin Reactivity in the Human B<sub>12</sub> Processing Enzyme CblC

2025· article· en· W4406823039 sur OpenAlexaff
Anna J. Esser, Santiago Sastre, Thien‐Ly Julia Dinh, Viola Tanner, Victoria Wingert, Katharina Klotz, Donald W. Jacobsen, Ute Spiekerkoetter, Oliver Schilling, Ari Zeida, Rafael Radí, Luciana Hannibal

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensChild, Adolescent and Family Mental Health
Organismes subventionnairesBundesministerium für Wirtschaft und EnergieUniversidad de la República UruguayDeutsche ForschungsgemeinschaftAgencia Nacional de Investigación e InnovaciónPrograma de Desarrollo de las Ciencias Básicas
Mots-clésCobalaminCysteineResidue (chemistry)ChemistryEnzymeBiochemistryReactivity (psychology)StereochemistryVitamin B12Medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human CblC catalyzes the indispensable processing of dietary vitamin B 12 by the removal of its β-axial ligand and an either one- or two-electron reduction of its cobalt center to yield cob(II)alamin and cob(I)alamin, respectively. Human CblC possesses five cysteine residues of an unknown function. We hypothesized that Cys149, conserved in mammals, tunes the CblC reactivity. To test this, we recreated an evolutionary early variant of CblC, namely, Cys149Ser, as well as Cys149Ala. Surprisingly, substitution of Cys149 for serine or alanine led to faster observed rates of glutathione-driven dealkylation of MeCbl compared to wild-type CblC. The reaction yielded aquacobalamin and stoichiometric formation of S -methylglutathione as the demethylation products. Determination of end-point oxidized glutathione revealed significantly uncoupled electron transfer in both mutants compared with the wild type. Long incubation times revealed the conversion of aquacobalamin to cob(II)alamin in the presence of oxygen in mutants Cys149Ser and Cys149Ala but not in wild-type CblC, all without an effect on dealkylation rates. This finding is reminiscent of the catalytic behavior of CblC from Caenorhabditis elegans, wherein Cys149 is naturally substituted by Ser, and the reaction mechanism differs from that of human CblC precisely by the unusual stabilization of cob(II)alamin in the presence of oxygen. Thus, Cys149 tunes the catalytic activity of human CblC by minimizing uncoupled electron transfer that forms GSSG. This occurs at the expense of a slower observed rate constant for the demethylation of MeCbl. This adjustment is compatible with diminished needs for intracellular turnover of cobalamins and with life under increased oxygen concentration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,866

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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