Abstract B027: Investigating NRF2-mediated radioresistance in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma preclinical models
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) that are not driven by human papillomavirus (HPV) are associated with a higher likelihood of treatment resistance and recurrence compared to HPV-positive HNSCC. There are currently no genomic-guided treatments for HPV-negative HNSCC, meaning that patients do not benefit from precision medicine approaches. Thus, it is critical to understand the mechanisms underlying HNSCC progression to identify molecular targets and better stratify therapeutic options for patients. NFE2L2 encodes for nuclear erythroid 2-related factor 2 (NRF2), a transcription factor that plays a crucial role in responding to oxidative stress by regulating the expression of genes associated with cellular defense mechanisms. Mutations in NFE2L2 and its negative regulator, KEAP1, make up approximately 25% of HPV-negative HNSCCs. Additionally, constitutive activation of NRF2 confers a growth advantage and causes resistance to chemotherapy and radiotherapy. We will elucidate the role of NRF2, identifying novel radiosensitizers to better guide therapeutic strategies for HPV-negative HNSCC patients. Methods: Using clonogenic and long-term viability assays measuring radiation response, we identified radioresistant and radiosensitive cells in a panel of 19 HPV-negative SCC cell lines. An area-under-the-curve (AUC) metric was used to measure cellular response to multiple doses of ionizing radiation. Reactive oxygen species (ROS) and DNA double strand breaks (DSBs) were quantified using DCFDA and γH2AX assays, respectively. Radiosensitization was measured using the ∆AUC of varying drug doses of NRF2 inhibitor, ML385. NFE2L2 and KEAP1 were knocked down using RNA interference in radioresistant and radiosensitive cells, respectively. Results: We identified 13 radiosensitive and 6 radioresistant cell lines out of the 19 HPV-negative SCC cell lines. There was a strong correlation between AUCs of the clonogenic and long-term viability assays (Pearson r=0.74, p=3.0×10–4). Six cell lines were consistently radioresistant (AUC>3.5) in both assays. None of the cell lines contained mutations in the NRF2 pathway, and only 1/6 were radiosensitized by ML385 (∆AUC=2); this effect was not correlated with ROS or DSBs, yet was abrogated by NFE2L2 knockdown. KEAP1 knockdown cell lines were generated for ongoing functional characterization and for genetic screens to identify radiosensitizers in HPV-negative HNSCC. Conclusions: We aim to identify the role of NRF2 in the treatment response of HPV-negative HNSCC. Although NRF2 is an important pathway in driving a radioresistant phenotype, the majority of radioresistant cell lines were not sensitized by NRF2 inhibition. Therefore, elucidating the molecular underpinnings of NRF2-mediated therapeutic resistance will be critical to identifying novel radiosensitizers with activity in HPV-negative HNSCC. Citation Format: Aakshi Puri, Meghan Lambie, Scott V. Bratman. Investigating NRF2-mediated radioresistance in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma preclinical models [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Translating Targeted Therapies in Combination with Radiotherapy; 2025 Jan 26-29; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2025;31(2_Suppl):Abstract nr B027.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».