Identifying the optimal post-surgical timing of molecular residual disease (MRD) detection in colorectal cancer (CRC) using an ultra-sensitive assay: Interim results from the VICTORI study.
Notice bibliographique
Résumé
275 Background: While detection of MRD using ctDNA is prognostic for recurrence in CRC, some patients still recur prior to MRD detection. VICTORI is prospectively investigating NeXT Personal, an ultra-sensitive NGS-based MRD assay, to profile patients with resected CRC. Methods: Patients with CRC treated with curative intent (all stages) are tested for MRD using NeXT Personal, a bespoke assay with up to ~1,800 tumor-informed single nucleotide variants (SNVs) identified from whole-genome sequencing. Plasma is collected prior to surgery, every 2 weeks post-surgery up to week 8 (MRD landmark window), and every 3 months for up to 3 years (surveillance). We present preliminary results on 397 samples from the first 62 patients. Results: A total of 62 patients (N=36 rectal [58%], N=26 colon [42%]; N=46 stage I-III [74%], N=16 stage IV [26%]) were included in our analysis. Baseline pre-surgical sensitivity (treatment naive) was 93.5% [N=29/31]. Pre-surgical positivity rate in patients who had received neoadjuvant therapy and had residual cancer at the time of surgery was 67% [N=16/24]. 60 patients were evaluable for clinical outcomes. At a median follow-up of 355 days, 15 patients (25%) had a recurrence. Of these, all patients were ctDNA-positive prior to recurrence (100%, 14/14; 1 pt excluded due to lack of samples prior to recurrence). ctDNA detection preceded clinical relapse by a median of 194 days [range: 5-397]); ctDNA for 78.6% (N=11/14) were first detected in the MRD landmark window. All landmark-positive recurrences occurred within one year of surgery. The 14 recurrent cancers with samples were first detected at a median ctDNA concentration of 28.7 parts per million (PPM) (range 2.4-111,120), with 64.3% (9/14) of those detections in the ultra-low range of <100 PPM. MRD detection at week 4 and week 8 had the greatest reduction in RFS (HR 12.86 [2.74-60.28], p=0.0012 week 4; HR 16.14 [3.52-74.09], p=0.0004 week 8), with weeks 4, 6 and 8 having similar higher prevalence of ctDNA detection (36.0% [18/50], 35.3% [18/51], 38.5% [20/52] respectively). Week 2 detection rate was 17.0% (8/46). cfDNA concentration was highest at week 2 (4.63ng/ml vs. 2.22 at baseline, p=0.00028) and 4 (3.68 vs. 2.22, p=0.0081), returning to baseline levels at week 6 (2.28 vs. 2.22, p=0.67) and 8 (2.48 vs. 2.22, p=0.64). Conclusions: In this interim report after a median ~1 year follow-up, NeXT Personal detected MRD for all patients prior to disease recurrence. Most initial MRD detection was in the ultra-sensitive range <100ppm and detection at 4-8 weeks after surgery was highly prognostic for recurrence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».