Tumour-free ctDNA detection as a decision tool to support organ preservation in node-negative rectal cancer undergoing neoadjuvant chemotherapy, excision, and observation in the phase II NEO trial (CCTG CO.28).
Notice bibliographique
Résumé
20 Background: In the NEO trial (CCTG CO.28, NCT03259035) patients with node negative (N0) T1-T3 rectal cancer were treated with neoadjuvant CAPOX/FOLFOX and transanal excision surgery (TES) with the goal of organ preservation. Patients without documented response following neoadjuvant chemotherapy were recommended total mesorectal excision (TME). We present a post-hoc assessment of ctDNA detection in this early-stage population and correlate kinetics with response and outcomes. Methods: Fifty-eight patients enrolled in CO.28. Whole blood was collected in EDTA tubes and processed for future ctDNA analysis at up to six timepoints: pre-chemotherapy, after neoadjuvant chemotherapy (and pre-TES), yearly during surveillance for 3 years and upon progression. A total of 195 samples were analyzed with the Guardant Reveal™ assay: a tissue-free epigenomic assay leveraging >20,000 epigenomic regions for ctDNA detection. Results: Of 48 available pre-treatment samples, ctDNA was detected in 22 (46%). Sensitivity by T-stage was 14% (1/7) for T1, 53% (17/32) for T2, 44% (4/9) for T3 cancers. ctDNA detection was lower following neoadjuvant chemotherapy (4/46, 9%, p<0.001 vs pre-chemotherapy). Of 41 patients with paired pre- and post-chemo samples, 49% (20/41) had undetectable ctDNA at both timepoints, 44% (18/41) had reduced tumour fraction following chemotherapy, the majority of which completely cleared ctDNA (94%; 17/18) and 7% (3/41) had an increased tumour fraction following chemotherapy (67%, 2/3 changing from negative to positive), all three of whom failed to respond to neoadjuvant chemotherapy and had TME recommended (100%). In contrast, of those that cleared ctDNA following chemotherapy, 35% had TME recommended (6/17, p=0.074). Of five recurrences (3 distant, 2 local), all had negative or reduced ctDNA tumour fraction during neoadjuvant therapy before surgical intervention. Among patients with local relapse who were managed with TES, 1/2 (50%) had detectable ctDNA at the time of local progression. No samples were available for those with distant recurrences (3/5) at time of relapse. Conclusions: The Guardant Reveal tissue-free assay was able to detect ctDNA even in this extremely early-stage cohort and identified cancers with inadequate response to therapy and in whom TME was recommended. A tissue-free approach may support timeliness of ctDNA results that would support ctDNA as an additional decision tool with endoscopic and MRI assessments to increase physician and patient comfort with organ preservation. Clinical trial information: 03259035.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».