Beyond Khorana score 2: Molecular correlates of venous thromboembolism in pancreatic cancer.
Notice bibliographique
Résumé
751 Background: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is associated with a hypercoagulable state leading to thrombosis. Risk models such as the Khorana score automatically classify PDAC as intermediate-high risk, and recent guidelines recommend consideration of thromboprophylaxis. However, little is known about the molecular correlates of PDAC for venous thromboembolism (VTE). Methods: We examined clinical and genomic data from the prospective multi-institution COMPASS trial (NCT02750657), which enrolled patients with treatment-naïve metastatic PDAC who underwent a fresh tumor biopsy for real-time whole genome and transcriptome sequencing. Laser capture microdissection was performed. Patients underwent restaging scans at 8-week intervals. Detailed chart review was conducted to focus on VTE risk factors, timing of VTE diagnosis, and anticoagulation. We also compared clinical and molecular factors based on timing of VTE diagnosis. Overall survival was defined as time from VTE to death. Results: Of 268 patients enrolled in the COMPASS trial, 166 patients had detailed clinical data available regarding VTE status. 82 patients (49%) developed a VTE, where 16 (20%) had breakthrough clots. Baseline epidemiological variables were similar for those with and without VTE, including no differences between age, sex, BMI, and baseline CA 19-9. No patients were on routine prophylactic anticoagulation. SMAD4 mutations were more frequently seen in the VTE subgroup (57% vs. 40%, p= 0.04), but no differences were seen in other driver genes (KRAS, TP53, CDKN2A), Moffitt subtype, or homologous recombination deficiency status. Patients who developed an early VTE (within 3 months) had a higher baseline CA 19-9 (median 4015 vs. 891, p= 0.02), and none were port-associated. A higher incidence of KRAS wildtype cases (10%) were observed in the early vs. later VTE groups (p= 0.03), but no differences in KRAS allelic status. There were no differences in burden of SNVs, indels, or SVs. Early VTE occurred in 46% of all basal cases, which are typically more aggressive, and only in 37% of classical subtypes. Overall survival was shorter with early VTE (HR 1.74, p= 0.02). Conclusions: A higher incidence of SMAD4 alterations were observed among patients with metastatic PDAC who developed VTE. VTE diagnosed earlier were associated with shorter survival, suggesting that early thromboprophylaxis should be considered at the time of diagnosis. Clinical trial information: NCT02750657 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».