Suppressing Tymovirus replication in plants using a variant of ubiquitin
Notice bibliographique
Résumé
RNA viruses have evolved numerous strategies to overcome host resistance and immunity, including the use of multifunctional proteases that not only cleave viral polyproteins during virus replication but also deubiquitinate cellular proteins to suppress ubiquitin (Ub)-mediated antiviral mechanisms. Here, we report an approach to attenuate the infection of Arabidopsis thaliana by Turnip Yellow Mosaic Virus (TYMV) by suppressing the polyprotein cleavage and deubiquitination activities of the TYMV protease (PRO). Performing selections using a library of phage-displayed Ub variants (UbVs) for binding to recombinant PRO yielded several UbVs that bound the viral protease with nanomolar affinities and blocked its function. The strongest binding UbV (UbV3) candidate had a EC50 of 0.3 nM and inhibited both polyprotein cleavage and DUB activity of PRO in vitro. X-ray crystal structures of UbV3 alone and in complex with PRO reveal that the inhibitor exists as a dimer that binds two copies of PRO. Consistent with our biochemical and structural findings, transgenic expression of UbV3 in the cytosol of A. thaliana suppressed TYMV replication in planta, with the reduction in viral load being correlated to UbV3 expression level. Our results demonstrate the potential of using UbVs to protect plants from tymovirus infection, a family of viruses that contain numerous members of significant agricultural concern, as well as other plant viruses that express functionally related proteases with deubiquitinating activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».