Contaminant-Associated Disruption of the Skin Transcriptome in the Endangered St. Lawrence Estuary Beluga
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide The St. Lawrence Estuary (SLE) beluga ( Delphinapterus leucas ) population in Canada is Endangered, and endocrine disrupting contaminants, such as polychlorinated biphenyls (PCBs), polybrominated diphenyl ethers (PBDEs), and other halogenated flame retardants, have been identified as a threat to the recovery of this population. Here, potential impacts of these contaminants on SLE beluga were evaluated by comparing skin transcriptome profiles and biological pathways between this population and a population less exposed to contaminants (Eastern Beaufort Sea) used as a reference. Differential gene expression analysis indicated potential seasonal or geography-related (Arctic vs temperate regions) effects on the skin transcriptome. Among the gene transcripts that were associated with Σ 31 PCB (123 genes), Σ 29 PBDE (198 genes), HBB (347 genes), and PBEB (126 genes) blubber concentrations, several were related to immune response pathways. In addition, 18 toxicology-related gene transcripts selected from the literature were correlated with organohalogen concentrations and were used to derive new threshold values in beluga skin for potential biological effects of ΣPCB (1,500 ng/g lw), ΣPBDE (52 ng/g lw), and two other flame retardants, i.e., HBB (1.2 ng/g lw) and PBEB (0.04 ng/g lw). Results suggest that exposure to these organohalogens pose a risk to the immune system of SLE beluga.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».