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Enregistrement W4406891469 · doi:10.31542/130faf10

Site-Directed Mutagenesis of Position 204 Threonine to Isoleucine Failed to Generate Acid-Tolerant EGFP

2025· article· en· W4406891469 sur OpenAlexvenueno aff
Milica Vignjevic

Notice bibliographique

RevueMacEwan University Student eJournal · 2025
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueChemical Reactions and Isotopes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsoleucineThreonineMutagenesisSite-directed mutagenesisGreen fluorescent proteinPosition (finance)GeneticsSaturated mutagenesisBiologyAmino acidChemistryMutationLeucineSerineGenePhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protonation of green fluorescent protein (GFP) in acidic conditions prevents the emission of fluorescent light and limits the ability to visualize, localize, and study acidic organelles. Therefore, it is critical to introduce mutations into enhanced GFP (EGFP) to generate acid-tolerant fluorescent proteins. This experiment aimed to replicate a threonine to isoleucine mutation at position 204 in EGFP and identify if acid-stable fluorescent proteins would be produced in the BL21(DE3) Escherichia coli system. Site-directed mutagenesis was utilized to generate T204I mutant EGFP. SDS-PAGE and fluorescence microscopy were employed to analyze induction success and fluorescence. Spectrofluorophotometry was used to determine the excitation and emission spectra of T204I mutant EGFP and whether acid-tolerant proteins were generated. Results illustrated that the mutation of threonine to isoleucine at position 204 produced fluorescent proteins at pH 7. However, at pH 6 and 5, proteins failed to fluoresce. The replication of the T204I mutation failed to generate acid-stable EGFP proteins in the BL21(DE3) E. coli system. There is significance in generating acid-stable cellular markers, as currently, no cellular markers thrive in acidic conditions. This limits the ability to study acidic organelles and acidic cellular processes. Creating acid-tolerant markers will permit a greater range of biological research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,354 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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